hello，大家好，抓住这一周最后的小尾巴，给大家汇总一下我们单细胞数据寻找差异基因的22种方法，之前我分享的一篇文章10X单细胞（10X空间转录组）基因集打分方法汇总[ht...
发简信
IP属地：江苏
-
10X单细胞（10X空间转录组）22种基因差异分析方法汇总 -
10X单细胞（10X空间转录组）基因集打分方法汇总
hello，大家好，今天周一，做一个简单的汇总，主要针对基因集打分，无论是单细胞还是空间，基因集打分都很普遍，方法也很多，我们来总结一下。 研究背景 在单细胞转录组测序中，整...
-
单细胞数据库
signatureDB - B cell数据库CancerSEA - 癌症单细胞KIT（肾脏单细胞数据库）：http://humphreyslab.com/SingleCel...
-
[富集分析] 1、背景知识1、富集分析的背景知识 - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/0b938d0e652c]2、clusterprofile富...
-
大家好，我叫杨俊伟，现就读于中国农业大学，在读博士，主要从事生物信息学方面工作。<br><br>人生格言：Take pains, be perfect
-
单基因的肿瘤细胞系表达怎么看？CCLE告诉你泛癌的基因表达量一般可以用TCGA和GTEx实现，但是肿瘤细胞系一般用CCLE临床生信之家[https://www.aclbi.com/static/index.html#/...
-
个人几年来的工作中整理的文档，部分是用他人文章中的内容，再加上很多自己的经验总结的内容。
-
生物信息相关网站
1、一般性网站生物谷 http://www.bioon.com 丁香园论坛 http://www.dxy.cn/bbs/ protocol online论坛 http:...
-
跟着Cell学作图|11.Ingenuity Pathway Analysis(IPA)跟着Cell学作图|11.Ingenuity Pathway Analysis(IPA) “实践是检验真理的唯一标准。”“复现是学习R语言的最好办法。” DOI: 10.10...
-
-
10X单细胞测序数据的降维方法及细胞亚型的鉴定聚类方法总结（基础知识）最近年中总结，我们学习一下基础知识 随着单细胞测序技术的发展，每个研究或实验中测定的细胞数量在显著增加。现在很多单细胞研究中，少则产生几百，多则产生几十万的细胞数量，甚至更多...
-
文献学习008--[sc]两篇PBMC单细胞文献阅读1. A single-cell map for the transcriptomic signatures of peripheral blood mononuclear ...
-
单基因TCGA的Cox森林图怎么画才好看首先调取Xena网页的TCGA数据做Cox生存分析，数据可以通过hiplot官网自主研发的ucsc-xena-shiny直接在线获取访问https://hiplot.com....
-
Read count、CPM、 RPKM、FPKM和TPM的区别1. 为什么我们要进行Normalization 测序深度：某些低表达量的基因只有在较高的测序深度时才能检测到。一般而言，随着测序深度的增加，基因种类以及可变剪接体的数目也会...
-
Kaplan-Meier生存分析的结果解读和绘制方法1. Kaplan-Meier生存分析 Kaplan Meier是一种单因素生存分析，它可用于研究1个因素对于生存时间的影响。参考：生存分析之Kaplan-Meier曲线都告...
-
GEPIA数据库单基因分析single gene analysis 检索框输入目的基因→GOPIA→单基因分析模块 总览（general） 提供基因基本信息以及其他门户、人体组织表达分布；泛...
-
QQ：28720864
