群体遗传学

基因的染色体定位分析 利用tbtools的 Gene Location Visualize From GTF/GFF工具，对染色体进行位置的绘制，这种是棒状的染色体图。 若想...

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家族成员的确定 找到 ”Batch-CDD"工具，输入上一步获得的hitdata.txt文件，以及蛋白序列文件，点击"start“，对其结构进行可视化. 基因家族的特征测定 ...

群体遗传学

此版本为无代码版本，依赖tbtools来实现，纯粹记录自己的学习经验。 蛋白序列的blast比对 选择拟南芥基因家族的蛋白序列文件 选择你想要查找的基因家族的基因组蛋白文件 ...

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@[TOC](SraToolkit 下载与安装) 第一步：进入NCBI选择“Download”, 进入后选择“Download Tools”工具下载。 第二步：选择“SRA ...

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上一篇文章：【群体结构】CLUMPP软件使用[https://www.jianshu.com/p/c2f252041e37] 前面讲到利用CLUMPP合并多个K值的结果，这边...

群体遗传学

最近在做群体结构分析，群体结构三剑客：structure、pac和kinship。这边我主要用的软件是structure，毕竟比较老牌，正常一个K值只要1天时间，我感觉还能接...

群体遗传学

群体进化-gwas分析 群体进化基础分析 PCA 分析原理PCA(Principal Component Analysis)，即主成分分析方法，是一种使用最广泛的数据...

群体遗传学

一、数据准备 首先，选取不同物种的Protein数据集：Arabidopsis_thaliana.fa；Citrus_grandis.fa；Dimocarpus_longan...

群体遗传学

Fasta序列长度的计算的原理就是将不同染色体长度存入哈希，最后用length去计算哈希元素（字符串）的长度。 perl脚本如下： 将上述代码写入length文件，并chmo...

群体遗传学

引言 今天给大家带来一个关于“撒币“的问题，说起”撒币“，最经典就是二项分布，也就是你拿起一枚硬币抛向空中，当它转体n个360°，最后华丽的落在地上，出现正面或者反面的概率。...