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最近一直在折腾结构变异SV的鉴定,SV的鉴定软件虽然很多,但是在最近的两篇基因组文章里面,主要用的是smartie-sv和bayesTyper,...
在安装python的模块时,报以上错误,需要安装libffi包。 libffi的安装 安装完之后,一定要把libffi的lib和include加...
降解组的分析,目前主流的软件为CleaveLand4,他可以通过测序数据来寻找miRNA与基因的剪切位点,从而验证miRNA靶基因的准确性。 C...
基因的染色体定位分析 利用tbtools的 Gene Location Visualize From GTF/GFF工具,对染色体进行位置的绘制...
家族成员的确定 找到 ”Batch-CDD"工具,输入上一步获得的hitdata.txt文件,以及蛋白序列文件,点击"start“,对其结构进行...
此版本为无代码版本,依赖tbtools来实现,纯粹记录自己的学习经验。 蛋白序列的blast比对 选择拟南芥基因家族的蛋白序列文件 选择你想要查...
由于最近用R语言跑的数据比较多,且都是重复的操作,跑一次时间长,所以尝试了下并行运算,所用的包为 parallel ,使用简单,易于上手。 pa...
@[TOC](SraToolkit 下载与安装) 第一步:进入NCBI选择“Download”, 进入后选择“Download Tools”工具...