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R语言生存分析03-Cox比例风险模型 -
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TCGA数据整合后进行DESeq2差异表达分析和基于R的多种可视化测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...
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TCGA数据库的利用（三）—做差异分析的三种方法！今天更新TCGA数据库的利用系列第三篇文章，在对TCGA数据进行挖掘时，通常会筛选出来一些表达量显著异常的基因，作为后续研究的对象，这个筛选过程叫做差异分析；本篇文章将分为三...
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手把手学会TCGA数据分析
在windows系统上进行TCGA数据的自定义分析，需要： 1，gdc-client，TCGA官网的下载工具专门用来下载TCGA中的数据； 2，RStudio，因为代码就是用...
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2020-01-07-TCGA之RTCGATCGA数据的另一个重要的包：RTCGA参考学习资料：TCGA之miRNA预测临床表现RTCGA（1） 数据概况与数据下载RTCGA（2） 数据分析与可视化https://w...
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"科研菌"团队每天为您提供高质量的原创科研论文精读、期刊投稿、资源分享和文章；每天一篇文章深度剖析，给您更开阔的科研思路。
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关于ID转换
背景 不同的数据库，标识同一个分子所用的的”代码“可能是不一样的，因为不同的数据库有自己标识分子的规则。当我们对一种ID不熟悉时，就经常需要转换成我们熟悉的ID。比如，在芯片...
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公共数据库挖掘之数据下载后处理
在上一篇简书中，我总结了如何下载数据链接如下：[公共数据库挖掘之利用R语言下载并整理GEO数据] https://www.jianshu.com/p/fd5c8389fb53...
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TCGA数据库的初次了解对于研究cancer相关的小伙伴们，相信你们在看文献的过程中，经常可以看到有些作者利用TCGA数据库里的数据进行分析、整合，得到很多有意思的思路。那么TCGA数据库是个啥？里...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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旅行，读书，编程
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生信人的GEO-1这是我学习jimmyB站的GEO数据挖掘-记下的笔记 视频直达：B站GEO数据挖掘 代码直达：github - jmzeng1314 了解GEO数据库 GSE,GSM,GPL...
