假设检验： 一般步骤： 1.设定假设后需要验证：假设0一般都是“处理组和对照组无区别” 2.构建检验统计量：根据样本数据计算统计量和检验统计量 3.设定置信区间：根据检验统计...
IP属地：辽宁
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【点】p value、FDR、q value
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p.value和FDR最近用limma作差异分析，接触p.value和adj.p.value比较多，今天就重点解释下p.value和FDR吧： 在topTable函数的结果里，我们都会看到p.va...
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@xiami554 感谢感谢，当时下载了好多次都还是报错，但最后我用这里的方法解决了。
https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyMzA2MTcwMg==&;mid=2650736922&idx=1&sn=e754b2933fe2d413b1c2f8fa75651ec7&chksm=f0285ab3c75fd3a5525b9fc61c68c6085f4adbd2617d8c736342085a3a5628b3357cca90fb64&scene=132&exptype=timeline_recommend_article_extendread_samebiz#wechat_redirectR错误 Shadow graphics device error: r error 4
我的R在版本由4.2.2更新4.3.1后使用remotes::install_github("YuLab-SMU/HPO.db") BiocManager::install(...
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你好，请问一下，我在更新R后，安装clusterprofiler时一直出现 ”不存在叫‘HPO.db’这个名字的程辑包“，不知道楼主有没有碰到过类似情况呢？感谢
R错误 Shadow graphics device error: r error 4
我的R在版本由4.2.2更新4.3.1后使用remotes::install_github("YuLab-SMU/HPO.db") BiocManager::install(...
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R错误 Shadow graphics device error: r error 4
我的R在版本由4.2.2更新4.3.1后使用remotes::install_github("YuLab-SMU/HPO.db") BiocManager::install(...
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KEGG注释：KEGG富集可视化柱状图很久很久以前，看到过文章中的KEGG富集可视化结果图。是对KEGG通路进行注释的。后来在一些测序公司的宣传页上也见到过类似的图： 其实这个图就是多了一个KEGG通路注释，近期...
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【R语言】卡方检验和Fisher精确检验，复现临床paper做临床数据分析的时候我们经常会用卡方检验或者Fisher精确检验去看看不同的临床特征在两组里面有没有显著差异。今天小编就带大家来重现一下下面这篇paper的Table2 Ta...
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老大醒脑题-我却迷糊了
问题链接看http://www.bio-info-trainee.com/4458.html 我碰到的问题 1.要不要把每个list变成data.frame,我给变成了，我首...
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GEO数据库 mRNA芯片分析全流程GEO数据库 mRNA芯片分析全流程 我们演示的数据集是GSE19136，样本可分为三组（对照组，支架组，紫杉醇组），具体实验设计情况请查看链接。本篇文章主要对对照组和支架组...
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GEO芯片数据差异表达分析前面简单给大家介绍过 GEO数据库数据检索方法（一）[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4ODE0NTE3OA==&mid=2649210...
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一个GSE有两个GPL该怎么办莎莎写于2020.5.7✍今天上午10点钟准时就醒了，然后和室友磨叽半天去实验室打扫卫生，然后签了字就偷偷溜了😄然后回到中校区买了超级甜的哈密瓜🍈还有火龙果，沃柑，一共是30...
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R语言中的连接dplyr中的join系列与merge函数
在数据分析过程中，仅仅涉及一张表格的情况是非常少见的，我们经常需要联系到其它表格的数据，整合这些表格的信息。这时我们需要常见的三类操作来完成。 合并连接：根据观测合并表格 筛...
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R包已上传Github免费给大家使用！差异基因筛选方法：基于基因表达秩序关系识别稳定逆转基因对
2022.3.20 初版2022.3.28 加入代码2022.11.30 免费给大家使用众所周知，差异基因的分析方法有很多种：①普通的差异基因计算方法（limma、edgeR...
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@天涯清水 还有一个疑问，这样做出来的结果就够了么？我看别人的文章中最后还会加一个统计分析的结果，请问大佬知道咋弄的么？
细胞周期实验：从protocol到数据分析（附免费软件）
细胞周期实验：从protocol到数据分析（附免费软件） 细胞周期，是指细胞从一次分裂完成开始到下一次分裂结束所经历的全过程，分为间期与分裂期两个阶段。细胞间期又分为C0期、...
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细胞周期实验：从protocol到数据分析（附免费软件）细胞周期实验：从protocol到数据分析（附免费软件） 细胞周期，是指细胞从一次分裂完成开始到下一次分裂结束所经历的全过程，分为间期与分裂期两个阶段。细胞间期又分为C0期、...
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大佬，能再分享下软件么？感激不尽
细胞周期实验：从protocol到数据分析（附免费软件）
细胞周期实验：从protocol到数据分析（附免费软件） 细胞周期，是指细胞从一次分裂完成开始到下一次分裂结束所经历的全过程，分为间期与分裂期两个阶段。细胞间期又分为C0期、...
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