IP属地：北京
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文献学习1：NeST: nested hierarchical structure identification in spatial transcriptomic data(NeST:对空间转...文章简介 背景介绍 Result: Identifying nested, hierarchical structure with NeST(使...
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SimplifyEnrichment：功能富集结果聚类去冗余和可视化文章简介 摘要 功能富集分析是生信分析基础的方法，对揭示感兴趣基因参与的生物进程至关重要，但是富集结果又长又冗余 很难总结 目前简化富集分析结果...
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soupX原理介绍文章简介 背景简介 soupX可以是单细胞转录组数据分析中 质控中的步骤。基于液滴法的单细胞转录组测序，液滴有以下其中情况，理想情况的 是单个细...
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单细胞与空间联合分析-CARD简介-20220721今天上午听了作者讲解CARD，基于去卷积方法进行空间与单细胞联合分析的软件，可以做： 单细胞cluster与空间数据联合 没有单细胞ref的数据...
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空间转录组简介-2022-07-04空间转录组学简介 原理 step1：新鲜冷冻组织切片成像冷冻组织不能直接用液氮，急速降温会导致细胞损伤，10X建议用OTC包埋的异戊烷速冻组织：...
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如何看单细胞（或空间）亚群间关系2022-07-03
方法1 umap降维图：亚群间距离越近，越相似 方法2 查看cluster间差异分析结果中marker基因，可从genecard中查看top的几...
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几种细胞死亡简介细胞凋亡Apoptosis 触发的细胞凋亡通路内源性的线粒体途径（BCL-2途径）由BCL-2蛋白家族的促凋亡和抗凋亡成员调节外源性的死亡受体途...
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TCGAbiolinks下载CNV数据存疑
下载步骤 使用TCGAbiolinks下载BRCA CNV数据，发现 data.type不全面，仅含有三种 Copy Number Segmen...
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2020-04-02 Rshiny 案例分享1 简介： 1.1 定义 1.2 优缺点 1.3 架构 2 ui对象包含的主要内容2.1 布局2.2 控件2.3 图片2.4 构建HTML元素 ...