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    Focal Loss理论及PyTorch实现

    一、基本理论 采用soft - gamma: 在训练的过程中阶段性的增大gamma 可能会有更好的性能提升。 alpha 与每个类别在训练数据中的频率有关。 F.nll_lo...

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    Docker学习

    杀杀记一个最近工作的小随笔需求:大佬的一个基因融合软件,已经封装在docker的镜像中,我们可以从网上下载这个docker 我们需要在本地安装软件用于管理docker镜像,并...

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    R语言 矩阵批量替换

    杀杀 最近学了几个矩阵批量替换的阳间方法,拒绝for循环! 应用:数据格式的标准化 我们在处理临床随访文件时,医生们通常会这样记录: 但是我们如果要进行生存分析或者风险分析或...

  • 等号赋值和<-赋值的区别是什么

    R语言编码风格

    ——by不是杀杀 为了使我们写的代码更容易阅读、避免过段时间再看自己写的代码就头疼,我们在写代码的时候应该注意一些编码风格。大家可以选择一种自己喜欢的风格约束自己的代码,以下...

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    如何生成指定长度的DNA序列

    ——by不是杀杀 前几天遇见一个简单的问题,但是我当我实际面对它的时候却发现好像也没我想得那么简单:如何生成指定长度的包含所有可能的DNA序列? 我们知道当DNA序列长度为4...

  • 你的思路很神奇,你生成这个东西的意义在哪里?(无非就两种)
    1. 为了看
    如果只是为了看和知道,那么完全可以直接套公式手动算。
    2. 为了循环
    如果是为了循环遍历,那么为什么不直接生成一个能够迭代的生成器(或者叫做迭代器)

    如何生成指定长度的DNA序列

    ——by不是杀杀 前几天遇见一个简单的问题,但是我当我实际面对它的时候却发现好像也没我想得那么简单:如何生成指定长度的包含所有可能的DNA序列? 我们知道当DNA序列长度为4...

  • 已经拖更了三天了,好好反省一下了

    使用oncoPrint绘制瀑布图

    杀杀生信分析中,我们在全基因组测序后会获得分子突变谱信息,如何直观地将各种疾病分子亚型下的基因突变特征,以及分子共突变/互斥突变的特征展示出来呢? 我们可以使用R语言中一个非...

  • 你这个比我的那个还随意

    一个简单的开始

    读了研究生之后发现跟自己所想象的生活完全不同,无论是摸鱼还是划水,我们还是想把这段时间记录下来~ 这里是一个初步汇总~ 会根据情况更新,并链接呦~当然,欢迎偶然进到我们小博客...

  • 自己去组台电脑,然后装 linux 系统会更香一点。我前年租了一个阿里云的巨贵

    当有了一朵云之后要做些什么(服务器配置及Linux常用命令和软件)

    ——by不是杀杀 在生信的学习过程中,非常多的工具没有办法在Windows下运行,因此服务器的使用是无法避免的。想要简单快捷地拥有一个能随意使用的服务器,除了向课题组服务器管...

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    GATK软件下载和安装

    GATK软件安装 搜索github,自行下载最新版本 Releases · broadinstitute/gatk (github.com)[https://github.c...

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    ascp下载数据

    下载Aspera Connect: 软件安装下载的方式有两种 第一种,直接从官网下载,然后解压安装(mac电脑我用的是这一种) 第二种,conda编译安装(wsl我用的是这一...