逸尘缘

您好，输入文件后显示Error parsing sequence data怎么解决，我的单倍型序列长度为
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2020-12-21利用PopART绘制单倍型网络图

A图中就是一个单体型网络，每个彩色圆代表一种单体型，圆的大小表示该单体型包含的样本数，两个圆之间的连线表示两个单体型彼此相关，连线上的短线表示从一个单体型变为另一个单体型需要...

夏大希

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逸尘缘

您好，我想分析线粒体基因组的密码子偏好性分析，剔除了小于300bp的cds序列后，得到的cds序列文件提交到codonw后得到的是每一个基因的密码子使用情况，那么这个基因组的结果就是这些所有结果的加和是吗？能不能把基因的名字去掉整合成一条序列提交到codonw，然后把生成的结果作为这个基因组的结果呢？

Codonw的安装与使用（密码子偏好性分析）

第一步 安装 第二步 使用 第一个界面有如上信息，在Select a menu choice, (Q)uit or (H)elp -> 后输入4并回车。 第二个界面有如上信息...

路人里的路人

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逸尘缘

第一步 安装 第二步 使用 第一个界面有如上信息，在Select a menu choice, (Q)uit or (H)elp -> 后输入4并回车。 第二个界面有如上信息...

逸尘缘

可以用gb文件吗

TBtools物种间共线性分析使用教程

首先非常感谢CJ老师开发的TBtools工具，给生信分析带来了极大的便利，详细内容介绍请参考https://www.jianshu.com/p/f39bff6c4746 一 ...

花舞lala

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逸尘缘

@笺牒九州的怪咖 好的 谢谢您的回复

基因组浏览器、BAM文件可视化工具（1）--- Tablet

在高通量测序数据的处理中（例如，在重测序研究、组装结果的re-mapping校正中），我们经常会将测序reads与参考序列进行比对（常见的如BWA、Bowtie等工具），并将...

笺牒九州的怪咖

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逸尘缘

@张振zz 好的 谢谢您的回复

叶绿体基因组的GetOrganelle组装、批量任务和结果合并

1 叶绿体的组装 1.1 GetOrganelle的安装 此处默认Anaconda已经安装，那么使用下面的命令即可安装GetOrganelle： 1.2 GetOrganel...

张振zz

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逸尘缘

您好 我更新了bowtie2之后怎么还是显示它不能用呢

叶绿体基因组的GetOrganelle组装、批量任务和结果合并

1 叶绿体的组装 1.1 GetOrganelle的安装 此处默认Anaconda已经安装，那么使用下面的命令即可安装GetOrganelle： 1.2 GetOrganel...

张振zz

7882 15 11

逸尘缘

您好，请问tablet软件对输入文件的大小有要求吗？我要输入的bam文件有点大，会有影响吗？还可以正常使用吗？

基因组浏览器、BAM文件可视化工具（1）--- Tablet

在高通量测序数据的处理中（例如，在重测序研究、组装结果的re-mapping校正中），我们经常会将测序reads与参考序列进行比对（常见的如BWA、Bowtie等工具），并将...

笺牒九州的怪咖

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逸尘缘

您好，用minimap2比对后生成的san文件后序应该怎么处理呢

Minimap2（2.20）使用记录

文章仅是记录自己的学习使用，有错误请指出，我立刻改正！ 官方说明：https://github.com/lh3/minimap2#general[https://github...

谁冒充我小叮当

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逸尘缘

您好，可以出一下详细的安装教程吗？

跟着Briefings in Bioinformatics学数据分析：植物线粒体基因组组装流程GSAT初步尝试

论文 Master graph: an essential integrated assembly model for the plant mitogenome based ...

小明的数据分析笔记本

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逸尘缘

这是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 从2016年，我开始自学生物信息，那个时候，为了加深自己学习，所以就不间断的在网上分享我的学习笔记。 我有一个自己的博客，xu...