您好，我想分析线粒体基因组的密码子偏好性分析，剔除了小于300bp的cds序列后，得到的cds序列文件提交到codonw后得到的是每一个基因的密码子使用情况，那么这个基因组的结果就是这些所有结果的加和是吗？能不能把基因的名字去掉整合成一条序列提交到codonw，然后把生成的结果作为这个基因组的结果呢？
Codonw的安装与使用（密码子偏好性分析）第一步 安装 第二步 使用 第一个界面有如上信息，在Select a menu choice, (Q)uit or (H)elp -> 后输入4并回车。 第二个界面有如上信息...
第一步 安装 第二步 使用 第一个界面有如上信息，在Select a menu choice, (Q)uit or (H)elp -> 后输入4并回车。 第二个界面有如上信息...
可以用gb文件吗
TBtools物种间共线性分析使用教程首先非常感谢CJ老师开发的TBtools工具，给生信分析带来了极大的便利，详细内容介绍请参考https://www.jianshu.com/p/f39bff6c4746 一 ...
@笺牒九州的怪咖 好的 谢谢您的回复
基因组浏览器、BAM文件可视化工具（1）--- Tablet在高通量测序数据的处理中（例如，在重测序研究、组装结果的re-mapping校正中），我们经常会将测序reads与参考序列进行比对（常见的如BWA、Bowtie等工具），并将...
@张振zz 好的 谢谢您的回复
叶绿体基因组的GetOrganelle组装、批量任务和结果合并1 叶绿体的组装 1.1 GetOrganelle的安装 此处默认Anaconda已经安装，那么使用下面的命令即可安装GetOrganelle： 1.2 GetOrganel...
使用软件：Geneious目的：对组装好的叶绿体基因组进行注释，注释好后进行查看，无误后绘制圈图 【注释部分】 1.首先从NCBI上下载一段与要注释的物种（目标序列）同源的物...
您好 我更新了bowtie2之后怎么还是显示它不能用呢
叶绿体基因组的GetOrganelle组装、批量任务和结果合并1 叶绿体的组装 1.1 GetOrganelle的安装 此处默认Anaconda已经安装，那么使用下面的命令即可安装GetOrganelle： 1.2 GetOrganel...
在高通量测序数据的处理中（例如，在重测序研究、组装结果的re-mapping校正中），我们经常会将测序reads与参考序列进行比对（常见的如BWA、Bowtie等工具），并将...
您好，请问tablet软件对输入文件的大小有要求吗？我要输入的bam文件有点大，会有影响吗？还可以正常使用吗？
基因组浏览器、BAM文件可视化工具（1）--- Tablet在高通量测序数据的处理中（例如，在重测序研究、组装结果的re-mapping校正中），我们经常会将测序reads与参考序列进行比对（常见的如BWA、Bowtie等工具），并将...
您好，用minimap2比对后生成的san文件后序应该怎么处理呢
Minimap2（2.20）使用记录文章仅是记录自己的学习使用，有错误请指出，我立刻改正！ 官方说明：https://github.com/lh3/minimap2#general[https://github...
论文 Master graph: an essential integrated assembly model for the plant mitogenome based ...
三代测序数据简单分析 原创 saber universebiologygirl 简单介绍： 三代测序技术读长较长，针对比较小的基因组像只有16kbp的人类线粒体DNA（mtD...
一、bwa （1）安装 （2）使用 1.下载参考基因组登陆NCBI网站GCA_000817325.1_ASM81732v1_genomic.fna2.准备工作 3.bwa i...
您好，可以出一下详细的安装教程吗？
跟着Briefings in Bioinformatics学数据分析：植物线粒体基因组组装流程GSAT初步尝试论文 Master graph: an essential integrated assembly model for the plant mitogenome based ...
这是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 从2016年，我开始自学生物信息，那个时候，为了加深自己学习，所以就不间断的在网上分享我的学习笔记。 我有一个自己的博客，xu...
