本节简单介绍Aspera安装和使用，并给出利用SRR号批量下载FASTQ或SRA数据的方法，通过比较发现aspera的下载速度与prefetch相比有了质的飞跃 前言：我们下...
IP属地：山东
-
Aspera——碾压prefetch命令的存在, 利用SRR号批量高效下载FASTQ或SRA数据 -
基因组组装----SOAPdenovo21.基因组组装的流程 基因组组装的大概流程如下： (1) 测序得到raw reads序列。 (2) Reads质量评估。 (3) 原始reads质控。 (4) 选择合适的参数...
-
测序中加入Phix的作用
转自http://www.zxzyl.com/archives/789 测序中加入Phix的作用 测序建库的时候，会加入一定比例的Phix，那么Phix文库有什么作用呢，我转...
-
16S扩增子之Vsearch使用
1.概览 2.PE reads拼接（fastq_mergepairs） 3.质量控制（fastx_filter） 去冗余与聚类生成OTUs或降噪生成ASVs（derep_fu...
-
-
为什么 BAM 文件 sort 之后体积会变小
测序数据比对结果 BAM 文件用 samtools 进行 sort 之后发现体积变小了...当时怀疑是不是 sort 过程中有一部分 reads 被丢弃了？于是统计了一下原始...
-
Metabolic interaction models recapitulate leaf microbiota ecology
微生物形成和植物健康和0生态系统功能密切相关。在环境背景下决定物种丰度机制不清楚，由于在植物叶际资源可用有限性，了解微生物分布和代谢能力可以为猜测物种间相互作用的奉献程度、植...
-
宏基因组数据分析流程代码熊金波实验室出品 整理归纳：Larry 本次学习使用的服务器IP地址和其用户名账户密码如下： 地址：gs0.genek.tv 用户名：u3276 密码：genek.tv（建议...
