微生物研究新世代 -- 三代全长16S (Full-length 16S) 时至今日,微生物群落研究已全面进入测序分析阶段,当前研究主流处于二代扩增子与三代扩增子交接的时段。...
微生物研究新世代 -- 三代全长16S (Full-length 16S) 时至今日,微生物群落研究已全面进入测序分析阶段,当前研究主流处于二代扩增子与三代扩增子交接的时段。...
Dada 2 流程 DADA2数据处理不以序列相似度聚类,只进行去重(或相当于以100%序列相似度聚类),生成的是以ASV为单元的表格;Vsearch数据处理与Usearch...
截取长度在50-100的序列 截取长度为50,51的序列
前几天学习了文献CUT&Tag[https://www.jianshu.com/p/335aec753039],了解了原理以后,可以跟着官网来学习如何分析CUT&Tag数据了...
文章会同步发表于本人 github 和 github homepage 目录 宏基因组binning简介binning原理2.1. 可用于binning的特征2.2. 从哪些...
参考: 嘉因生物讲座视频:CUT&Tag 技术解析和应用 ChIP-seq 需要的数据量很大:组蛋白:10M; TF: > 50 M 交联 : 可能改变抗原表位,影响抗体结合...
完整流程、注意事项、统计原理:http://blog.sciencenet.cn/blog-118204-1111379.html[http://blog.sciencene...
前情回顾: 单细胞时代 || 细胞身份概念的演变[https://www.jianshu.com/p/c56313177a31]单细胞时代 || 网络分析应用进展,机遇与挑战...
步骤1:以适当的格式加载和读取OTU表:设置目录的方式与我们在前几章中所做的相同。“td_OTU_tag_mapped_lineage.txt”数据集包含两条信息:最后一列中...