2022年7月，刘仁义团队（福建农林大学）和张兴坦团队（福建农林大学/中国农科院深圳农业基因组研究所）在Horticulture Research期刊（IF=7.291）发表...
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2022《Horticulture Research》| 泛转录组+GWAS/eQTL解析茶树次级代谢物调控网络 -
NC | PRISM4基于微生物基因组序列预测次生代谢产物的结构和生物活性文献信息 标题：Comprehensive prediction of secondary metabolite structure and biological activ...
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基因家族分析（1）——基因家族成员的确定②
更多内容关注微信公众号：“今日之森” 后获取。 直奔主题 基因家族分析（1）——基因家族成员的确定①简单介绍了一下分析策略和数据下载。 今天就随便找一篇文章，通过实践操作来快...
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KaKs_Calculator2.0+ParaAT计算两个物种间的Ka/Ks
1.软件安装 ⭐KaKs_Calculator2.0⭐ParaATKaKs_Calculator2.0[https://sourceforge.net/projects/ka...
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基因组共线性工具MCScanX使用说明MCScanX是检测基因共线性和进化分析的常用工具之一，2012发表至今引用数200+，作者之一的唐海宝老师是国内植物基因组学生信分析、软件开发领域的大拿，在学习使用MCSc...
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基因家族分析5 || 共线性分析及可视化共线性分析（Synteny analysis）及可视化 基因家族流程：基因家族分析（一）[https://www.jianshu.com/p/34333a6d7c4e] 基因...
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根据基因名称批量提取基因序列实验中经常需要从基因组中提取、序列用于设计引物，或者进行基因功能研究等，之前看到别人使用的一个脚本，自己拿来用一下，感觉确实很方便 在网站[http://hgdownload...
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Augustus 基因从头预测
目前的从头预测软件大多是基于HMM(隐马尔科夫链)和贝叶斯理论，通过已有物种的注释信息对软件进行训练，从训练结果中去推断一段基因序列中可能的结构，在这方面做的最好的工具是AU...
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PAML学习手册(1)
最近工作中经常会用到PAML，发现很多东西不是很明白，所以从官方网站上找到了PAML手册(http://abacus.gene.ucl.ac.uk/software/paml...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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#GTF/GFF格式# gffread入门使用
首先了解一下GTF/GFF的格式https://asia.ensembl.org/info/website/upload/gff.html两者的关系如下 GTF (gene ...
