一、介绍 KEGG[https://www.kegg.jp/kegg/] 是一个数据库资源，用于从分子水平信息，特别是基因组测序和其他高通量产生的大规模分子数据集，了解生物系...
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KEGGREST使用方法
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R包clusterProfiler: 转换ID、GO/KEGG富集分析参考这篇ID转换不用怕，clusterProfiler帮你忙这篇详细讲了无参考基因组该怎么办，值得一看 简单介绍一下几种常用的ID：Ensemble id：一般以ENSG开头...
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interpro 注释结果简单分析及可视化Interpro数据库 Interpro是集成了蛋白质家族、结构域和功能位点的非冗余蛋白质特征序列数据库， Interpro数据库成员包括Coils 、Gene3D、Pfam...
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Interpro 数据库介绍
InterPro是一个数据库，其提供蛋白序列的功能分析并归纳为一个个蛋白家族，同时还预测了presence of domains和important sites。为了将蛋白分...
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2020-05-05使用SignalP对蛋白序列进行信号肽预测
信号肽简介信号肽是蛋白质N-末端一段编码长度为5-30的疏水性氨基酸序列，用于引导新合成蛋白质向通路转移的短肽链。信号肽存在于分泌蛋白、跨膜蛋白和真核生物细胞器内的蛋白中。 ...
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SignalP 5.0：信号肽预测信号肽（signal peptides）：是引导新和成的蛋白质向分泌通路转移的短肽链，长度约5-30个氨基酸；对应的mRNA序列，在起始密码子后，有一段编码疏水性氨基酸序列的...
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蛋白质的跨膜螺旋结构域预测（transmembrane helices ,TMH）膜蛋白分析：生物膜所含的蛋白叫膜蛋白，是生物膜功能的主要承担者。生物体大约30%蛋白质都是膜蛋白，而膜蛋白是药物的主要靶标。许多膜蛋白是兼性分子，它们的多肽链可以横穿膜一次或...
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TMHMM 2.0--蛋白质的跨膜结构域预测如何预测一个蛋白是否具有跨膜螺旋（TMH）？ 蛋白结构决定蛋白功能，利用生物学在线软件工具TMHMM Server,v.2.0版本是蛋白质跨膜螺旋的在线分析工具。TMHMM是...
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WoLF PSORT——亚细胞定位在蛋白质分析中，不可避免的需要考虑其在细胞中的位置，为其功能的鉴定和分类奠定基础，下面将讲述如何利用在线方式来进行subcellular localization. 1.首...
