从研一来到组里,一直听到 GO 富集分析几个字。直到现在,研二基本结束了,我都没做过,也不会做。有一个大概的认识,就是,自己的基因集中某种功能基因的占比要高于这种功能的基因在...
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从研一来到组里,一直听到 GO 富集分析几个字。直到现在,研二基本结束了,我都没做过,也不会做。有一个大概的认识,就是,自己的基因集中某种功能基因的占比要高于这种功能的基因在...
1. RDA的基本方法描述 冗余分析(RDA)和基于转化的冗余分析(tb-RDA) Rao(1964)首次提出冗余分析(Redundancy analysis,RDA),从概...
实际上,最近几年我已经参与了若干物种的基因组学项目。我一直在思考:除了提供一批数据之外,我们的研究还能对实际生产产生怎样的推动作用?基因组组装和基因注释在整个育种研究中处于什...
实话说,这是一个非常庞大的问题,因为这个牵扯到服务器硬件,系统等软件因素,还有一些网络问题导致的玄学问题,复杂性导致它很有挑战。但是,我们不能因为有挑战性就放弃了,毕竟总会不...
随着技术的发展,动植物的全基因组测序到现在已经超过了2000个,而且这个惊人的数字是在最近三年内得到爆发的。这样体量的数据涌现,为分子生物学的发展提供了巨大的助力。最近三天身...
1.更新R 打开现有版本的R, 这时会提醒很多,要不要安装最新版,安装路径,装完了要不要把旧的R包拷贝过来等等,一路yes此时就安装成功了,关闭两个版本的R 2.Rstudi...
之前画热图一直在用pheatmap,简单美观,但是后面有了些特殊需求之后,人就不知足了,所以转到了功能更全面但是相对更难入手的 ComplexHeatmap[http://w...
此模板以shell语言下经常用到的长数据变宽数据为例输入数据 aaa,第一列必须为计数,二三列不特殊要求,不含列命 run: 得到两个文件,以bbb为前缀