学习材料 The UMLS What is it and how to use it(PPT) UMLS及其在智能检索中的应用[http://manu44.magtech.c...
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【单细胞转录组】人类T细胞亚群分析Marker基因汇总T 细胞（全部）：CD3+ Naive T cell: CD3, CD4, CCR7, CD62L+, IL-7R (CD127), THPOK Tef（效应T细胞）： 辅助...
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python和R写出表达矩阵为稀疏矩阵matrix.mtx.gz的方法
背景 ：将大型矩阵保存为稀疏矩阵格式的意义在于减少存储空间和提高数据处理的效率。稀疏矩阵是一种特殊的矩阵，其中大部分元素为零。相比之下，密集矩阵中的大多数元素都是非零的。在大...
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GDSC数据库使用（分析基因表达量与药物敏感性影响）
数据下载：不要下载raw data细胞系注释文件： Cell-line-annotation[ftp://ftp.sanger.ac.uk/pub/project/cance...
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sctransform通过仿射变化对单细胞数据进行标准化参考文献链接：《Normalization and variance stabilization of single-cell RNA-seq data using regu...
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单细胞数据整合分析——批次效应（batch effect）去除在单细胞分析当中，经常会遇到整合分析的问题，即去除多样本数据之间的批次效应（batch effect），那么什么是批次效应呢？简而言之，批次效应就是由于不同时间、不同实验人员...
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单细胞SCENIC分析原理和流程介绍SCENIC官网：https://rawcdn.githack.com/aertslab/SCENIC/701cc7cc4ac762b91479b3bd2eaf5ad5661...
