单细胞空间交响乐

作者，Evil Genius 周一了，这一篇我们来讨论关于单细胞 + ATAC多样本、多组学整合分析的方法。 分两种情况，一种是样本分两份，一份做RNA，一份做ATAC，另外...

百奥智汇

随着单细胞测序技术的发展，各种多组学技术都被逐渐引入到这一大家庭中来。上一期我们给大家介绍了单细胞转录组+表面蛋白测序技术，本期我们将聚焦另一种多组学技术——单细胞转录组+染...

单细胞空间交响乐

作者，Evil Genius 疫情真的是严重啊，北京健康宝继续弹窗，但是，不影响大家好好看文献，做科研。 在上一篇文章单细胞多组学整合分析方法讨论[https://www.j...

单细胞空间交响乐

作者，Evil Genius 周五了，一周又过去了，时光匆匆，珍惜当下。 这一篇来分享一些关于单细胞RNA + ATAC联合分析的细节问题。 在发表于nature的文章Spa...

生信卷王

写在前面 其实很多作者已经探索的差不多了，相关脚本、教程也很多，但我还是自己系统的总结一下吧。有时候感觉是浪费时间，但是在写的时候能发现并学习到很多新的知识，不断记录反思，也...

生信卷王

部分代码参考自10x genomics官网[what-is-cell-ranger-atac]，但绝大多数代码融入了我自己的思考 1、上游分析（软件安装 + 数据获取 + c...