理论基础 在上篇的比对中,我们需要纠结是否真的需要比对,如果你只需要知道已知基因的表达情况,那么可以选择alignment-free工具(例如salmon, sailfish...
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自己在参考大牛的基础上,总结了RNAseq比对流程pipeline脚本。在做好前期准备工作后,可以一步完成从fastq到表达矩阵的所有步骤,目前仅支持human Bulk R...
作为生命科学的从事者,不论是老师或者学生都应该用过NCBI((National Center for Biotechnology Information Search d...
在之前学习snakemake的基础上,这里重新又对之前编写的pipline进行了优化,只需要在config.yaml中输入相应的samples,以及参考基因组路径,即可以得到...
⚠️该教程的PCA绘图基于ggplot2,可以根据ggplot2语法对图片进行额外的修改和保存。 1. 基础 PCA:全称Principal Component Method...
对于服务器配置的大概情况 一、首先是偏硬件的说明 1、首先是对于CPU的说明服务器CPU性能参数主要信息可以通过查看/proc/cpuinfo获得。具体查看指令及效果如下: ...