这个取决于上游Hi-C preprocess数据分析的软件。上游用Juicer可以直接.hic文件转.mcool。其他软件我一般写脚本手动将文件重整为bedpe格式。具体可以参考https://cooler.readthedocs.io/en/latest/cli.html#cooler-cload-pairs
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上一篇：(PNAS 2019) scHiCluster （Part I：文章梳理）[https://www.jianshu.com/p/5ef81eca986c] 原文：Zh...
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