IP属地：贵州
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DNA甲基化测序数据处理（一）：数据比对前言 因为组里面出了一批甲基化测序数据，使用的技术为BS-seq，处理的时候顺带记录了学习过程，演示使用数据为官方提供的example.fastq。 DNA甲基化及CpG岛定...
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学习生物信息，我都应该掌握那些内容？持续更新ing.....最后更新时间：2019/3/8 10:28 AM 1.linux命令 1.1 linux的权限 权限： eg： 7=4+2+1 #代表w+r+x权限...
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第2篇：原始数据的质控、比对和过滤这部分内容包括对原始测序数据质控，然后比对过滤，这是所有NGS数据处理的上游分析。 ATAC-Seq与其他方法不同的一点是需要过滤去除线粒体（如果是植物，还需要过滤叶绿体），...
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fastq、fasta、bed、gtf、gff、sam、bam生信分析常见文件格式查看生信分析过程中的文件格式：除了原始测序数据fastq、fasta之外，还有基因组文件fasta格式，基因注释文件gtf格式。在分析的过程中还会有众多中间文件的生成，如bed、...
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Trim Galore ——自动检测adapter的质控软件之前分析过的测序数据，数据质量都很好，给了我一个错觉质控的前后差别不是很大，内心里对质控这一步也就不是很重视，跑完质控有时也懒得看结果，拿到一批测序数据后，也总是忽略了去看测...
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努力成为R 极客<br>R和python爱好者<br>bioninfomatics
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
