发简信
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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您好，请问 怎么读取这个数据进去呢？？BW格式的：ATAC1084.mm10.片段.rpm.bw
ArchR官网教程学习笔记1：Getting Started with ArchR
前面的学习笔记里，对于scATAC-seq的分析，使用的是signac R包进行的。前几天在一次偶然的机会里，有幸和一个专门做生信的老外聊了聊（纽约某校的PI），从他那里听说...
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单细胞分群——T细胞的markers
调节性T细胞 调节型T细胞（Treg）细胞激活信号 TNFRSF9 (4-1BB) # PMID: 35121991 CD8+ T细胞 耗竭型T细胞（Tex）PDCD1，C...
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这个世界流行离开，但我们却不擅长告别
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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请问各位大佬，怎么自己调整AUC阈值，然后作图呢？？
AUCell：在单细胞转录组中识别细胞对“基因集”的响应
使用AUCell识别单细胞rna数据中具有活性“基因集”(i.e. gene signatures)的细胞。AUCell使用“曲线下面积”(Area Under the Cu...
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不看私信<br>看不到的文章是被简书锁了
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小白初学R（day1）——从单细胞数据分析开始不积跬步无以至千里 安装R语言，工欲善其事，必先利其器，作为生信小白，安装R语言也走了不少弯路，要注意R语言和RStudio是搭配安装的哦 详情见网址“https://blo...
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传说中的 “bio生物信息” 首席编辑
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周运来，男，长大了才会遇到的帅哥，稳健，潇洒，大方，靠谱。一段生信缘，一棵技能树。生信技能树核心成员，单细胞天地供稿人，简书创作者，单细胞数据科学家。
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欢迎学习交流
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捋一捋---活化的CD4 T cell 都有哪些亚型一：什么是CD4、什么是CD4T cell、什么是Actived CD4 T cell? CD4，属于免疫球蛋白超家族的成员，主要表达于大部分胸腺细胞、T细胞亚群，在巨噬细胞...
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2022-03-07：substr函数在TCGA数据中提取样本信息1：了解substr函数（截取函数），从start位置开始提取字符串，示例如下 2：用substr函数在TCGA数据中提取样本信息 tumor <- colnames(exp...
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遗传学 博士研究生在读
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使用clusterProfiler进行富集分析clusterProfiler是业界大神Y叔写的R包，看过了它的绘图就会使人沉迷于其颜值无法自拔。本文很多内容直接翻译自官方文档，加上了我的测试数据（还是以果蝇为例）。 一、...
