R语言笔记——'org.Hs.eg.db'脱坑记录 'org.Hs.eg.db'是发布在bioconductor平台上面的一个数据库文件,该包中装有较多的主流数据资料文件,但...
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SRA(Sequence Read Archive)数据库是用于存储二代测序的原始数据的数据库。除了原始序列数据外,SRA现在也存在raw reads在参考基因的比对信息。 ...
clusterProfiler包做富集分析后,可直接使用配套的可视化函数展示结果,最常见的形式有barplot、dotplot。网上有很多相关的推文,今天咱来说点不一样的...
本节概览:1.获取DEG结果的上下调差异基因2.bitr()函数转化基因名为entrez ID3.利用clusterProfiler进行KEGG与GO富集4.用enrichp...
关于RNAseq Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这[https://app.yinxiang.com/fx/f8c7f63c-a05e-4ebf-...
使用conda 安装samtools总是报错,尝试报错文件软连接仍然报错。最后根据以下方法单独下载安装,samtools可正常使用。 来源:https://www.jians...
STAR+RSEM+Deseq2视频课程链接已经公开, https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN?p=8[https://www...
第一次接触环境变量,也是似懂非懂,直到这次自己改对了,不是纯粹复制脚本,才弄明白,原理就是弄个快捷方式而已。 主要是能看懂这行代码 =号前和:后都是固定格式,不用管,只要看明...
FastQC是一款依赖Java环境的高通量序列数据的质量控制工具,目的是为高通量测序的原始序列数据提供一种简单的质量控制检查方法。它提供了一组模块化的分析,在后续分析前,快速...