GEOdatabase下载了一个.loom文件，想要用一下这个数据，折磨了一周，终于成功的将它转换成了seurat对象，现记录如下：数据为GSE162183，地址：https...
IP属地：天津
-
loom文件转换成seurat对象 -
单细胞转录组高级分析六：TCGA生存分析
本文是参考学习单细胞转录组高级分析六：TCGA生存分析[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyMzMwNDQ2MA==&mid=22474...
-
clustree为聚类可视化在单细胞的研究中，经常需要做的就是聚类。在聚类的时候，对于聚出多少个cluster，一个相关的参数是resolution，当数值小的时候，cluster少，数值大的时候，cl...
-
FindClusters选择多少resolution合适？日常瞎掰 昨天看到一个关于女孩找对象方面的笑话，大概内容是这样的：一个女孩天天为应该找一个什么样的男朋友而纠结，于是这个女孩便向大师寻求帮助。 “大师，我应该找一个什么...
-
GEO单细胞数据读取
1.有直接的标准10X数据（喜大普奔）解压缩后可以得到三个文件（barcodes.tsv/genes.tsv/matrix.mtx），文件名修改到一模一样例如：GSE1062...
-
disgenet2r:一个R包解决人类疾病分子功能的全部研究前言 Immugent在之前写过一个推文：DisGeNET数据库：人类疾病相关基因研究的百科全书[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4M...
-
IOBR:一个R包带你走进数据挖掘的殿堂
鉴于前一段时间有小伙伴私聊 Immugent 说生信宝库是不是专门只写单细胞相关的推文呀，其实，这只是凑巧最近发的都是单细胞相关的。虽然近几年产生了大量的单细胞数据，但bul...
