生信小白一枚,<br><br>有问题可以私信我,<br><br>谢谢。
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通过前期的分析,我们确定了感兴趣的module,但是module中又含有几十甚至上百的基因,下一步需要进一步筛选hub gene。 WGCNA(3):基因模块与性状关联识别重...
1 公共数据下载SRA Toolkit安装方法:进入服务器 下载包命令:wget 及复制下载链接 https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra...
数据是我转录分析的到的基因表达量 导入数据如图所式: 此表格为某个基因在两个样本即CM和HP三个生物重复的表达Mean和SE(SE为标准误差,可用来评估准确性或精确性,用来估...
kallisto+sleuth是在转录本水平上进行直接分析的方法。 首先先在服务器上用conda下载kallisto进行分析(conda的安装及下载方法会另出一篇单独写),k...
质控过滤软件有cutadapte trimmomatic trim_galore fastp 等,在选择对数据处理的软件时,要根据质控结果选择最优的。 刚开始对转录组原始数据...
RNA-seq分析简洁版[https://www.jianshu.com/p/72c871663e62],用重新下载的肝癌数据[https://www.ncbi.nlm.ni...