简介 scCustomize是一个单细胞转录组数据可视化的R包，里面集合了一些常用的数据可视化方法，可以与Seurat包进行很好的联用，支持Seurat，LIGER和SCE等...
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scCustomize：自定义可视化你的单细胞数据（一） -
R-Seurat V5 to H5AD
最近想将单细胞数据从Seurat转换到H5AD格式，但发现Seurat V5直接转换会报错。这里记录一下解决的方案。 直接转换会报错 Error in assay.group...
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跟着Cell学单细胞转录组分析(八):单细胞转录组差异基因分析及多组结果可视化
接着单细胞下游分析： 从Cell学单细胞转录组分析(一):开端！！！[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg5OTYzMzY5Ng==&mid...
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clustree ： 聚类可视化利器我们知道在研究问题时，分组是很重要的，有分组才有故事可讲。比如，两块田一块施肥一块不施肥，可以做比较嘛。在单细胞数据分析中用到较多的数据分组技术是聚类（clustering）...
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单细胞分析踩坑实录：DotPlot()之'RNA' assay还是 'integrated' assay?前段时间在生信技能树单细胞学习小分队分享单细胞文章复现，一不小心就踩了一个坑……记录在这儿和大家一起分享。 背景 主要是想复现2020年发表在 PNAS 上的一篇题为 Sin...
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samtools 安装过程出现的问题及解决
使用以下步骤安装 : 出现的问题：samtools可用，但是基本命令如ls、pwd等无法使用，使用该命令（export PATH=/bin:/usr/bin:/usr/loc...
