1前言 ROH参数的设置越看越复杂《How to study runs of homozygosity using PLINK? A guide for analyzing ...
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ROH分析流程及各种参数的选取 -
ROH分析及热点区域计算0写在前面 脚本方面充斥着CHATGPT，复制粘贴。尽管每个步骤都实际运行过，但因为是一边实验一边写，难免存在错误各种排版，细节问题懒得细抠了这篇文章又被锁定了 1.文件处理...
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01 甲基化基础知识——学习于生信技能树公众号
甲基化基础知识 基础知识甲基化是表观修饰的一种表观遗传修饰是指对基因组功能的相关修饰，通过一系列生物学修饰改变基因的活性而不是DNA的核苷酸序列影响基因的表达。对基因组功能的...
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DNA甲基化数据分析全流程
2021-01-01 更新 简单记录一下平时的分析过程 和RNA-seq前期流程类似 -- 质控、去接头、比对参考基因组、排序 后期就是要提取甲基化位点，包括CpG、CHG、...
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甲基化数据预处理（R语言）一. 实验目的 学习如何下载甲基化数据及如何获得每个探针的甲基化水平（beta值）。 二. 实验数据及步骤 数据：来自GEO GSE27284_non-norm...
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使用bismark进行甲基化分析并使用IGV对结果进行可视化Bismark是进行甲基化分析过程中常用到的软件，可以将bisulfite处理后的测序reads比对到参考基因组上，得到参考基因组相应位置的甲基化水平。 我的甲基化数据为WG...
