当你心烦意乱、人生迷茫时，如果能在这里找到问题根源，或是发现解决问题的方向或灵感，将是本账号最大的荣幸，也是作者继续前进的动力
IP属地：重庆
-
怎样和『以自我为中心』的人相处？这个世界，有各种各样类型的人存在。特别是有这样一类人，不管说什么、做什么，都喜欢强调：我想怎样怎样、我是什么什么、我能如何如何…这是典型的“自我中心主义”人格障碍。除了自己，...
-
Bcftools以及比较两个VCF
bcftools详解[https://www.jianshu.com/p/266c55c87978]bcftools系统性练习[http://evomics.org/lear...
-
SNP对转录因子结合及基因表达的影响
单核苷酸多态性（SNP）是基因组DNA序列变异的主要形式。但大多数的snp并不影响蛋白质序列，这些SNP主要通过对基因表达调控来影响生物个体。研究转录因子与snp位点的结合性...
-
系统进化树简介及构建系统进化树学习笔记。 系统进化树简介 系统进化树（Phylogenetic tree）：用一种类似树状分支图形来概括各节点之间的进化关系，节点可以是不同物种、同一物种不同样本...
-
这或许是我写的最全的BLAST教程Basic local alignment search tool (BLAST) 包括：blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等....
-
富集分析天花板之ClusterProfiler4说在前面 在国内做生信的小伙伴或多或少都听过一个大名鼎鼎的名字---Y叔，想当初小编初入生信大门时还专门百度查了一下，他就是南方医科大学生物信息学系主任余光创教授。Y叔在国际...
-
rehh：单倍体/单倍型群体间选择信号分析（基于selective sweep）本文介绍的方法都是基于Extended Haplotype Homozygosity (EHH)概念，由SABETI 等人在 2002年提出。简单来说，根据selective...
-
群体遗传学-选择清除分析一、中性学说 分子水平上，生物的演化或物种的进化并不是自然选择引起的，而是由中性/近中性的突变等位基因经过遗传漂变引起的，从而形成分子水平上的进化性变化或种内变异。分子演化的...
-
如何喂养我们的灵魂？春天的脚步越走越远了，夏天也在蠢蠢欲动地要破门而出了。 不过，今天还是个春光明媚的日子，春天这个顽皮的少女还在尽情地跳跃着最后的收场舞蹈。作为观众，我也没有拒绝她的美意，也在...
-
测序深度和测序覆盖度，怎么估算？在我们开始测序之前，经常会被问道，你需要的测序深度和测序覆盖度的概念，比如在测序线粒体的DNA时候，测序小哥就问说1个G的数据量够了吗？下面就给大家解释下这两个概念： 测...
-
Mac下独立设置触控板和鼠标的滚动方向新入手MacBook Pro，触控板很灵敏，各种手势功能也很强大，不过长时间在板子上摸，指头不舒服，还是外接一个鼠标吧。 微软3600蓝牙鼠标，无需接收器，干净利索，熟悉的手...
-
eggnog-mapper使用记录
这两天在基因课上学了一下eggnog-mapper，先看文章，然后看视频课程，正好工作有需要对一批转录本进行功能注释。捣鼓一下，在基因课的服务器上操作的，特此记录一下。 文章...
-
应该是最好的eggnog-mapper功能注释教程eggnog-mapper实现功能注释 eggNOG-Mapper介绍 通常功能注释的思路都是基于序列相似性找直系同源基因，常见的方法就是BLAST+BLAST2GO， 或者...
-
R 函数笔记 | grep()函数与R语言中的正则表达式
grep()能对向量中特定条件的元素进行查询，默认return为index。grep()语法与grep()大致相似，但默认return为logical。 grep() 代码如...
-
人生苦短，我用 Python 之快速遍历 PPT
故事背景是这样的，某一天师兄突然交给一项任务。虽然他吧啦吧啦地说了一堆，但是简单总结起来就是现在有个一千页的PPT和一个一千行的txt文档，要做的事情就是把txt文档中的一千...
-
-
-
ggtree实现系统发育树可视化
背景1：Newick格式 Newick是最常用的存储进化树的文件格式，如上面这个树，拓朴结构用newick格式可以表示为： (B,(A,C,E),D); 括号最外层是根节点，...
