你好,我出现了报错:
Error in names(dat2)[i:(Star - 1)] <- names(dat[, i]) :
replacement has length zero
找了好久找不到原因,基本数据是按照你的形式改的。能帮我看看吗
【R】批量T检验注意事项 本代码适用于Student T检验,别的统计方法需要改代码 本代码中默认数据符合正态分布且方差齐,如果数据对这两项敏感,则需要提前检验 数据准备 将数据按下表的形式...
菜鸟终于做到生存分析了。 首先准备好你的数据,数据最重要的两大要点:1要有生存时间time2要有事件的状态 截尾or死亡 看一下我准备的数据 head(d)ID time s...
再请问一下,我只有两个样本,一个样本是对照组,一个样本是实验组,做Limma分析做不了,该用什么包?
GSVA + limma进行差异通路分析一般我们做GSEA都是先进行差异基因分析,然后取差异倍数排序结果进行GSEA。但如果你没有条件进行差异基因分析也可以进行GSEA,这就是ssGSEA(single sampl...
请问一下,gene_Set里面是表达矩阵基因名的集合吗?
D11 2 理解GSVA 单个基因集的GSVA先保存,下次有时间再整理
请问一下, keggSet这里面的内容是什么。我是测序的数据,只有基因的entrizid编号,怎么获得?
GSVA + limma进行差异通路分析一般我们做GSEA都是先进行差异基因分析,然后取差异倍数排序结果进行GSEA。但如果你没有条件进行差异基因分析也可以进行GSEA,这就是ssGSEA(single sampl...
“差异基因kegg注释图”是转录组分析结果的重要组成部分,能够帮助大家了解差异基因分属于哪些代谢通路,文章中如果能够插入下面这类图来说明样品间的差异,一定会为你的文章增色不少...
Gene Ontology 可分为分子功能(Molecular Function),生物过程(biological process)和细胞组成(cellular compon...
什么是基因富集分析? 基因富集分析(gene set enrichment analysis)是在一组基因或蛋白中找到一类过表达的基因或蛋白。一般是高通量实验,如基因芯片,R...
所用R包:pheatmap #pheatmap画热图,TP53基因三个探针的表达量 #重点在于整理数据: #1,分组信息对应的样本编号annotation-col #2,所需...
未完待续。。。