转录组测序的最直接目的,就是设法寻找组间显著表达变化的基因,解释基因表达水平的变化对生物功能的影响。例如,肿瘤患者与正常人群相比哪些编码蛋白或非编码RNA分子发生了失调,这些...

转录组测序的最直接目的,就是设法寻找组间显著表达变化的基因,解释基因表达水平的变化对生物功能的影响。例如,肿瘤患者与正常人群相比哪些编码蛋白或非编码RNA分子发生了失调,这些...
序 言 生信分析真的是跑下别人的软件就ok了么?很明显这样认为有些肤浅。先不说软件好不好用的事,即使勉强能够正常运行得到结果就万事大吉了么?这里也不讨论数据好坏的问题,得...
背景 经常在HiC文章中看到TAD边界强度变化图,大体上可以反映TAD之间隔绝情况,绝缘系数越低,TAD之间交互越弱。如下图: 画图的方法: 有点类似ChIP-seq pe...
作者:Jenny审稿:童蒙排版:amethyst 引言 在表观多组学联合分析中,我们经常会遇到想对某个区域可视化,每当看到高分文章里漂亮的tracks图,就羡慕不已。今天小编...
转自:https://www.sohu.com/a/220053461_761120[https://www.sohu.com/a/220053461_761120] 写在前...
写在前面 半个月前,我推了一个《任何人都能掌握-基因家族分析》的腾讯课程(原本事实是开给课题组)。在热身课程(完全免费)中,将我个人对基因家族分析的认知和其意义均做了说明,感...
写在前面,得到HiC-pro的结果后,我们想看看显著的互作区域以及两个样本互作区域的不同. 关注正常染色体 比较不同实验组数据大小,如果相差比较大,利用shuf随机提取等量数...
github:https://github.com/eldariont/svim-asm[https://github.com/eldariont/svim-asm] ref...
本文学习费章军老师文章Genome of Solanum pimpinellifolium provides insights into structural variant...