导 读 本章介绍T细胞的抗原识别分子，即T细胞受体（TCR）。上图概述了TCR组装的主要步骤。如第2章所述，TCRs识别肽抗原有一个必要条件，那就是该抗原需要由自身主要组织相...
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第7章：T细胞受体(TCR)概述2021-04-17 -
单细胞Seurat V5分析流程自从seurat V5更新之后呢，很多小伙伴，初学者居多吧，都有点不适应，再加上网上有些人的“煽风点火”，导致大家望而却步，好像这次更新非常可怕一样。其实不然，seurat的...
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Seurat的三种单细胞数据整合方法汇总（批次校正）2022-05-24
关键词 批次效应 批次校正 单细胞数据整合 适用背景 单细胞数据由于实验平台或样本等原因会造成不同数据集之间存在批次效应，这种批次效应是人为因素造成的，没有实际的生物学意义，...
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2021-05-23 ChIP-seq数据从头到尾比对及分析汇总（个人分析记录贴）0_1 前言 有时间再详细写introduction。先把我分析数据的流程记录下来，后续持续更新。 0_2 用到的软件或脚本 测序数据质控：fastp[https://git...
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如何提取ATAC-seq数据的差异peaks?（DiffBind包的使用）2021年开年第一篇笔记~ 这篇笔记主要记录DiffBind包的学习。在很久以前我写过一篇ATAC-seq分析流程（ATAC-seq分析练习[https://www.jian...
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ChIP-seq实践(H3K27Ac,enhancer的筛选和enhancer相关基因的GO分析)在实践之前，我先查找了一下有关组蛋白修饰的知识点：（参考文章：https://www.jianshu.com/p/8aca72809c5c） 组蛋白修饰能预测染色质的类型（异...
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一文读懂 ChIPseq
一、介绍 ChIP-seq，测序方法ChIP 指染色质免疫共沉淀技术（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP），seq 指的是二代测序方法 作用...
