研究生，常做实验，生信小白。
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用TBtools，快速高效实现基因组共线性分析与可视化， 赞！写在前面 对于没有做过共线性分析的小伙伴，可以通过以下几段内容，了解一下，我为什么要费劲巴拉画出这样一张图。 除了基因组成的相似性,在不同基因组中基因排列顺序的一致性更能够体...
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备忘！<br>备忘！<br>备忘！
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分析 | 比较基因组 | 共线性分析
网上已经有很多教程，自己尝试梳理。 共线性分析，你会想到什么？基于蛋白编码基因1.1 MCScanX[https://github.com/wyp1125/MCScanX] ...
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MCScanX共线性分析共线性 共线性片段是指一个同一个物种内部或者两个物种之间，由基因组复制、染色体复制、大片段复制以及物种分化而产生的大片段同源现象。同源片段内部基因排序保守，意味着功能上也可能...
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基于orthofinder 结果构建物种树
串联法 orthofinder 已经生成好单拷贝基因串联的序列，可以直接使用。找到orthofinder 已经生成好单拷贝基因串联的序列，SpeciesTreeAlignme...
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主要关注于脊椎动物适应性进化与比较基因组学研究<br>简书原账号：WhyDoWeAge
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关于PhastCons和SIFT4G的使用
由于分析需求需要使用PhastCons分析DNA的保守序列，以及使用SIFT软件分析氨基酸变异的有害性，经过一段时间的探索，对这两款软件已经有了还算全面的认识，在此记录一下分...
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我是外科医生，所以很粗暴的哟！～～<br>欢迎大家关注微博“医学小蛋散”哦～<br>让学医快乐～ <br>记录行医之旅～
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GWAS分析-说人话（22）-"最终章"
前言 “天下没有不散的筵席”～ 正如开章所说“这个年代，谁™还有人做GWAS啊？！” 也没有想到这个系列是最受欢迎的， 亲们所看到1-21章操作出来的文章，今天的状态更新了 ...
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一些常用小脚本记录
记录下小编自己可能用到的小脚本 （1）fasta转phylip格式 用法：python fa2phy.py seq.fasta seq.phy （2）fastq转fast...
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小江同学
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Hyphy，不亚于Paml的选择压力分析的优秀软件，使用指北
近几年来，Hyphy的使用人数越来越来多，虽然不及paml，但这款软件的一些优秀特性使得它值得受到使用和关注。首先相比paml，hyphy有以下几大优点： 操作使用简单。 运...
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hyphy计算选择压力(+pal2nal的使用)官网：http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www.bork.embl.de/pal2nal/[http://...
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一条小咸鱼
