KS科研分享与服务

最近微信群有小伙伴抛出这样一张图，是一个细胞通讯LR气泡图，确切的说应该是Cellchat结果的可视化。我一看这不就是用Cellchat做的嘛。没什么难度，做一下！这个相比于...

斯希笔记

1.利用箱线图比较两类样本的某个细胞比例差异 比较直观，但是缺点在于如果单细胞样本个数过少且异质性大，导致很难有统计学显著意义 2.R o/e 比值 好多文章都有用这个，我的...

黄甫一

使用背景 我们一般拿到单细胞矩阵需要做的一个预处理步骤是去双胞，而常用的一个R包是DoubletFinder[https://github.com/chris-mcginni...

青青青山

1 亚群合并 当有几类亚群同属于某类细胞时，比如CD4+ T细胞和CD8+ T细胞均属于T细胞，想要将他们合并在一起时，可以使用此代码。 推荐使用第二种方法，这样不更改原始亚...

Hayley笔记

练习数据集的GEO编号：GSE139324 (Immune Landscape of Viral- and Carcinogen-Driven Head and Neck C...

Seurat_Satija

此教程展示了使用 scVelo 分析存储在 Seurat 对象中的 RNA 速率值。如果您在工作中使用 scVelo，请引用下文： Generalizing RNA velo...

小丑竟是我自己0815

通过动力学建模将RNA速率推广到瞬时细胞状态 RNA速率开辟了利用scRNA测序数据研究细胞分化的新途径。RNA速率基于剪接和非剪接mRNA的比率描述了在一个给定时间点上，一...

生物医学小站

文章题目：Single-cell analyses define a continuum of cell state and composition changes in t...