R/qtl是一个可扩展的、交互的、用于QTL定位的R包,集数据分析和绘图于一体。特点是使复杂的QTL定位方法被广泛使用,使用户专注于建模而不是计算。 官网:https://r...
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IP属地:台湾
R/qtl是一个可扩展的、交互的、用于QTL定位的R包,集数据分析和绘图于一体。特点是使复杂的QTL定位方法被广泛使用,使用户专注于建模而不是计算。 官网:https://r...
在R中进行整理,pmap格式在下面帖子中有详细介绍。第一列为SNP的ID,第二列为chr,第三列为SNP的位置,第四列开始为每个性状的SNP的P值。9.3 GWAS:关联分析...
今天在使用CMplot画曼哈顿图时遇到一个bug:Error in if (sum(pvalueT <= 0) != 0 || sum(pvalueT > 1) != 0) ...
准备文件 gene_r.csv基因型 phe_r.csv表型 计算
这是很多年前做的关于作图群体的PPT,懒得再排版了,直接截图上传了,需要PPT的可以私信小编。在介绍作图群体前我们先看一下之类性状和数量性状的差别: 当然还要知道几个基本的概...
SFS的基本理解、介绍的一篇文章:https://theg-cat.com/tag/joint-sfs/[https://theg-cat.com/tag/joint-sfs...
作者:童蒙编辑:angelica 一、介绍 Flye是用于单分子组装数据的denovo基因组装的软件。这个软件可以用于各种数据集,从小的细菌到大的哺乳动物。 输入是原始的Pa...
备注:本文主要来源于知乎《全新的泛基因组解决方案》[https://zhuanlan.zhihu.com/p/335553740]。关于大豆泛基因组文章解读,请看往期记录《大...