Hayley笔记

在非监督的单细胞数据分析中，给定细胞cluster的均一性往往是不清楚的，也就是说我们并不知道分出的一个cluster中是否是一种细胞，还是依然包含了多种细胞。因此有人提出了...

FTDdata

RStudio Server是网页版的RStudio，相比于单机版，它的灵活性更强，部署在服务器上后，可随时随地完成R语言的工作。并且能很方便的完成R项目的部署调试。本文介绍...

我与生信

前一篇推送解读了今年发在NG上的鉴定玉米抗旱基因的文章。文章中一个比较关键的分析是从泛基因组水平鉴定结构变异。作者应用并评估了四款常用的软件：SyRi、Smartie-sv、...

Boer223

本文的部分内容来源于“Comprehensive evaluation and characterisation of short read general-purpose ...

生信宝库

说在前面 我们在前面通过3篇推文介绍了张泽民老师的系列研究成果张泽民老师系列文章解读(一)[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY5...

XIAO沉

在多篇高分文章中都出现了评估细胞亚群纯度的内容，用到的是张泽民团队的ROGEU包。提出了一个基于熵的统计量(ROGUE)来准确地定量鉴定的细胞团的纯度，可应用于所有测试的sc...

Hayley笔记

scRNAseq免疫细胞注释： 免疫细胞注释-1：T细胞[https://www.jianshu.com/p/0127c9b380c9] 免疫细胞注释-2：髓系细胞[http...

云养江停

单细胞分析流程之Cell Ranger 相信做单细胞的小伙伴对Cell Ranger这个软件都不陌生，我们今天就来了解一下Cell Ranger的安装和使用方法。Cell R...