results[[2]][["consensusClass"]]就是样本分成2簇的信息
一致性聚类ConsensusClusterPlus介绍 一致性聚类是一种为确定数据集中可能的聚类的数量和成员提供定量证据的方法,例如作为微阵列基因表达。这种方法在癌症基因组学中得到了广泛应用,在那里发现了新的疾病分子亚类。 ...
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一致性聚类ConsensusClusterPlus介绍 一致性聚类是一种为确定数据集中可能的聚类的数量和成员提供定量证据的方法,例如作为微阵列基因表达。这种方法在癌症基因组学中得到了广泛应用,在那里发现了新的疾病分子亚类。 ...
您的分享很详细,帮助挺大,谢谢
R语言ggboxplot-一文掌握箱线图绘制所有细节作者:白介素2相关阅读:R语言ggplot2绘制箱线图R语言生存分析04-Cox比例风险模型诊断R语言生存分析03-Cox比例风险模型R语言生存分析-02-ggforestR...
看到楼上已评论了,嘻嘻,其实就是add=“”,这个参数来设置是否显示点点,不想显示就#掉这个参数即可
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你好,我想请教您一个问题。readLength这个参数后边接的是质控后fastq文件中reads的长度还是测序的reads长度??谢谢啦
2019-08-29 rMATS找可变剪切与可视化python /media/shen/disk1/biosoft/rMATS.4.0.3beta/rMATS-turbo-Linux-UCS4/rmats.py --b1 m...
@刘小泽 好的,谢谢
利用linux处理fq/fa小练习刘小泽写于19.1.11知识就是这样,越用越熟练,像awk、grep、sed等,用时间长了就有感觉了;另外所有我们遇到的问题都能搜索到,所以不用担心办法解决这份题不是我出的,...
你好,有没有方法能把FQ格式文件数据的前50bp提取出来,并保持数据完整性呢?
利用linux处理fq/fa小练习刘小泽写于19.1.11知识就是这样,越用越熟练,像awk、grep、sed等,用时间长了就有感觉了;另外所有我们遇到的问题都能搜索到,所以不用担心办法解决这份题不是我出的,...
你好,我想请教一下,,做伪时间的输入文件是啥样的?
Monocle拟时间分析Monocle可以进行下面三种类型的分析,可以与seurat无缝连接: 1 对细胞进行聚类、分组和计算;2.进行拟时间分析;3.差异表达分析; 2.Constructing ...
(不是软文,真实经历) 万万没想到,在踏入PAIR的办公室那一天,竟然是将我人生轨迹扭转的开始。 我是一名来自中山大学的标准中等生,攻读生物技术专业,GPA在三等奖边缘来回试...
@MC学公卫 对对对,我刚问了师兄,他也说是版本问题
实验记录3:用R包Seurat进行QC、PCA分析与t-SNE聚类版本信息: Seurat v2.0不是3.0!现在Seurat更新了3.0版本,下载也是默认的3.0,这篇记录只适用于用2.0的。 梗概 将Cellranger中的基因表达矩...
32738个基因,2700个细胞(其实就是hg19这个人的单细胞测序数据)另外有个问题:matrix.mtx文件的第一列是什么信息?
实验记录3:用R包Seurat进行QC、PCA分析与t-SNE聚类版本信息: Seurat v2.0不是3.0!现在Seurat更新了3.0版本,下载也是默认的3.0,这篇记录只适用于用2.0的。 梗概 将Cellranger中的基因表达矩...