首先，标准化的英文是Standardization，归一化的英文是Normalization，正则化的英文是Regularization。标准化是特征缩放的一种方式，需要注意...
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正则化，归一化，标准化的区别与联系 -
[R构建函数基础篇] 计算多样性指数及绘图本节来介绍如何R来自定义构建函数来进行多样性指数计算及绘图 加载R包 导入数据 定义函数计算多样性指数 导出指数计算结果 整理绘图文件 在此选取我们需要的数据来进行展示 定义...
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三代测序数据组装三代数据组装 Pacbio CLR & Nanopore: 50X~100X，最低不能低于30XPacbio HiFi : 25X 以上 三代读长的优势 推荐软件 canu ...
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三代测序数据组装（补充）nextdenovo nextdenovo 最初开发用于nanopore 数据拼接，也支持pacbio CLR 和HiFi 数据做输入。软件运行速度较快。 下载地址：http...
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利用minimap2和samtools简化目标基因组拼接
最近打算测一些干燥材料和标本材料的浅层基因组，有些材料降解严重，拼接的过程可能会比较困难。由于我们的目标主要是转录组的数据，所以试试看能不能在拼接之前将与转录组无关的序列直接...
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windows 下的blast+安装以及使用
blast+的安装 1.程序下载：访问blast本地软件包链接 blast_latest下载适合自己系统的blast版本。2.安装流程：下载完毕后，双击安装到C:\Blast...
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理解并操作BAM文件经过了第四节的长文，我想大家基本上已经知道了一个WGS流程该如何构建起来了吧。但在那一节中限于篇幅有两个很重要的文件我没能展开来讲，分别是：BAM和VCF文件。这篇我们先说B...
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基因组浏览器、BAM文件可视化工具（1）--- Tablet在高通量测序数据的处理中（例如，在重测序研究、组装结果的re-mapping校正中），我们经常会将测序reads与参考序列进行比对（常见的如BWA、Bowtie等工具），并将...
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从bam/sam 生成可视化 IGV .tdf 文件；Generating .tdf from bam/sam for IGV
Chinese version: 写在前面：半吊子生信人，一路摸摸索索各种查，为了避免忘记，还是做个记录吧 （所以参数如何改之类还是建议查官网） 老板给我sam文件，问能不能...
