前面测试了常见的人类和小鼠的数据集，但是我自己是做植物的。如果想要运行pySCENIC，就需要去建立自己的数据库。关于这块网上的资料，我自己也是遇到了一些问题，现在把自己的流...
IP属地：浙江
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【pySCENIC】构建其它物种的motif数据库 -
文献学习058--[sc+EndMT]猪的多器官单细胞图谱建立的单细胞网站：pig single-cell atlas database[https://dreamapp.biomed.au.dk/pigatlas/]文章代码：ht...
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【DoRothEA】单细胞转录因子分析今天学习另外一个转录因子活性预测工具：DoRothEA。很多文章用的也是这个工具，看起来比pySCENIC好像快很多。其实，单细胞转录因子分析本质上是计算一种specific...
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请问解决了吗
创建大鼠cistarget参考数据库
运行SCENIC做单细胞的转录因子分析时遇到一个问题，就是运行SCENIC所需的输入文件中需要用到cistarget database的参考motif文件，而这个在SCENI...
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厦大本科，清华生科院博士生在读，对表观遗传，计算生物学，发育生物学领域感兴趣
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可以统计NA的个数码
R——按行按列计数某个值出现的次数
感觉使用编程语言一定要理解它的步骤含义，不然就算会使用它进行数据的处理，也很容易就会忘记，下一次还是会琢磨不透。 有一个星期多没有写代码处理数据了，昨天突然不会使用apply...
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请问pch是什么？
R语言可视化（十六）：PCA图绘制
16. PCA图绘制 清除当前环境中的变量 设置工作目录 加载示例数据 使用prcomp函数进行PCA分析 使用基础plot函数绘制PCA图 使用ggplot2包绘制PCA图...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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