前面测试了常见的人类和小鼠的数据集,但是我自己是做植物的。如果想要运行pySCENIC,就需要去建立自己的数据库。关于这块网上的资料,我自己也是遇到了一些问题,现在把自己的流...
IP属地:浙江
前面测试了常见的人类和小鼠的数据集,但是我自己是做植物的。如果想要运行pySCENIC,就需要去建立自己的数据库。关于这块网上的资料,我自己也是遇到了一些问题,现在把自己的流...
建立的单细胞网站:pig single-cell atlas database[https://dreamapp.biomed.au.dk/pigatlas/]文章代码:ht...
今天学习另外一个转录因子活性预测工具:DoRothEA。很多文章用的也是这个工具,看起来比pySCENIC好像快很多。其实,单细胞转录因子分析本质上是计算一种specific...