获取AAV衣壳蛋白组装体的结构pymol中使用命令: 下载FindSurfaceResidues脚本从FindSurfaceResidues - PyMOLWiki[http...
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Pymol获取蛋白表面残基
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python库lifelines进行生存分析
A Complete Guide To Survival Analysis In Python, part 1 - KDnuggets[https://www.kdnugge...
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ilus: 这是我写的一个轻量级全基因组（WGS）和全外显子（WES）最佳实践分析流程生成器不知觉间，距离我写下第一篇关于 WGS 数据分析系列的文章已经过去了三年多（WGS 系列文章[https://mp.weixin.qq.com/mp/homepage?__b...
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PDBx/mmCIF 文件格式(三)
PDB-101: Learn: Guide to Understanding PDB Data: Missing Coordinates and Biological Ass...
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【陪你学·生信】十三、蛋白质3D结构简单预测
我们关注蛋白质的功能，而结构和功能联系紧密。一旦在氨基酸序列水平发现有趣的序列（比如一个模体（motif）或者进化上保守的片段），下一步往往就是研究这段序列的3-D结构。（...
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基于AlphaFold2进行蛋白质结构预测的文章解析01 蛋白质结构基础 基础介绍[1][#fn1] 蛋白质是一切生命系统的物质基础，密切每一个生理过程。 每个蛋白质因基酸链的组成、扭转、弯曲等等构成不同具有特异的结构，决定...
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PDBx/mmCIF 文件格式(二)原文传送门：PDB-101: Learn: Guide to Understanding PDB Data: Dealing with Coordinates (rcsb.o...
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PDBx/mmCIF 文件格式(一)
PDBx/mmCIF Syntax 原文链接：PDBx/mmCIF Syntax (wwpdb.org)[https://mmcif.wwpdb.org/docs/tutor...
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Guideseq分析流程Guideseq是一种检测体内基因编辑脱靶的测序方法，基本原理是CRISPR系统剪切基因组后，在进行基因组修复时可能会将一段设计好的双链DNA，即tag，插入到基因组中，通过...
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python open函数newline参数
python open函数的newline参数控制着如何转换和输出换行符，下面是官方解释: newline controls how universal newlines w...
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SAM/BAM文件HEADER/FLAG/CIGARSAM文件HEADER: SAM Format Header[https://www.samformat.info/sam-format-header] SAM文件每一列的信...
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seaborn + matplotlib 画图(四): 自定义子图+拟合线虽然matplotlib的subplot函数可以方便的绘制子图，但是无法对子图大小进行自定义，而axes()函数可以通过设置轴域的范围来自定义子图的大小。下面为一个示例： 1...
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@周鲁晓夫 这个没有哦
RNAseq转录组分析流程：fastp+hisat2+samtools+featureCounts+DESeq2
使用工具 fastp(质控), hisat2(比对), samtools(sam文件转bam文件), featureCounts(count计数), DESeq2(差异分析)...
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Notepad++运行python使用Notepad++运行python代码: 在Notepad++里编辑好代码并保存，或者打开一个python文件image.png F5运行或者通过菜单栏运行，弹出下面的菜...
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楼主你好，请问多个blocks的时候怎么计算qij和eij呢
BLOSUM矩阵的推导
BLOSUM62是应用得最广的氨基酸替换矩阵，是BLAST中蛋白质序列比对的默认矩阵。 1. 如何下载替换计分矩阵 ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/...
