KS科研分享与服务

DESeq2是一个比较常用的转录组分析R包，包的使用非常简单，与之前的limma包不一样，DESeq2需要的数据是Row counts矩阵，这点非常重要。 首先我们读入下载的...

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其实转录组现在很普及了，一个样品的测序价格也非常低。转录组的作用几乎如同于PCR一样常见，在很多文章中只是一个验证的作用，很少有文章单纯靠转录出发做一个研究，除非你有非常好的...

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转录组差异基因分析有很多包，常见的或者公认的却只有这么几种，edgeR包介绍完之后，我想所有人应该能够轻松应对普通转录组的差异分析了。 还是利用上节的数据： 安装并加载R包：...

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什么是UMAP？和PCA一样，一种降维的算法，如果不是统计学或者数据专业的人，我建议不要去看它的原理，知道如何用就足够了。 也许听到UMAP最多的是对单细胞数据的分析降维，类...

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从这节开始，就逐渐涉及转录组的基本可视化了，我们的可视化要做到CNS级别的图，争取做好分析，一步到位，让您有真正的收获！ PCA（主成分分析），具体的原理就不说了，自行百度。...

学习生信的小兔子

对于两组数据间的差异分析，最常见的方法就是使用T检验比较两组均值是否存在显著不同。当拓展到多组（三组及以上）时，使用T检验逐一两两比较的方法无疑是低效的，不仅仅由于需要的检验...