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Nature | 肝癌免疫微环境亚型和中性粒细胞异质性免疫微环境的异质性是肿瘤耐药、复发和预后差的重要原因之一[1-3]。近年来，免疫治疗及联合治疗给晚期肿瘤患者带来希望，系统探究肿瘤免疫微环境的异质性对于治疗选择、疗效预测、方...
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单细胞marker整理
##20220423 ESCC_marker plasma： IGHG3、IGHG1、MZB1 JCHAIN B： CD79A、MS4A1、IGHM、CD19、CD79A、C...
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TCGA 数据分析实战 —— GSVA、ssGSEA 和单基因富集分析前言 前面，我们介绍过了差异基因的功能富集分析，今天，我们对这部分的内容作一些补充 主要介绍一下 GEVA、ssGSEA 和单基因的富集分析 GSVA 我们知道，GSEA 富...
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R绘图应用实例：成组的t检验及绘图本文主要是利用日常实验数据，尝试用R绘制与Graphpad一样的线条图和柱状图。 实验数据：采用RNAi技术干扰ago1和dcr1两个基因，然后荧光定量检测干扰效果，计算出相...
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ArchR官网教程学习笔记16（下）:ArchR的轨迹推断分析系列回顾：ArchR官网教程学习笔记1：Getting Started with ArchR[https://www.jianshu.com/p/a2bcdfb77961]A...
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scRNAseq || 堆叠小提琴图(StackedVlnPlot)的4种实现方式最近一直在学习单细胞方面的知识，无意中看到别人的帖子在分享如何画堆叠的小提琴图(StackedVlnPlot)，顺便就学习了一下。发现StackedVlnPlot图确实看...
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如何解决注册Google账号手机验证不通过的问题很多人不知道如何用中国手机号注册谷歌账号，注册谷歌账号手机号码提示不可用，注册谷歌账户时最后一步验证账户输入手机号说此电话号码无法用于进行验证如何解决？ 轻松三步走注册Goo...
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Linux - top命令Linux - top命令 ps 命令可以一次性给出当前系统中进程状态，但使用此方式得到的信息缺乏时效性，并且，如果管理员需要实时监控进程运行情况，就必须不停地执行 ps 命...
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ChIP-seq数据分析实战训练（四）
homer软件来寻找motif 下载数据库 运行homer软件 homer软件找motif整合了两个方法，包括依赖于数据库的查询，和de novo的推断,都是读取ChIP-s...
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你好，请问你跑完之后是如何进行可视化的呢？
使用pyscenic进行单细胞调控子计算
注：pyscenic发表在Nature protocol上，题为：A scalable SCENIC workflow for single-cell gene regula...
