了解什么是UMI,什么是barcode,再做分析之前,知道他们是在测序中引入,了解为什么引入即可。 看个简介的视频吧 从了解10X genomics开始陈巍学基因:http:...

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1、数据在不同环境中的兼容情况 目前V5版本的环境可以兼容V3版本的数据,但是V3环境中导入V5环境会报错(缺依赖包)。目前有两种方式新建R对象数据CreateSeuratO...
40. 网络图绘制 清除当前环境中的变量 设置工作目录 使用igraph包绘制网络图 使用ggraph包绘制网络图 使用networkD3包绘制动态网络图
编写:王采荷 感觉已经很久没有在简书上分享自己的东西了,今天在集合其他大佬的力量终于把“如何用R语言做差异代谢物的kegg富集分析”这个问题给解决了。我决定将这个过程分享到简...
decostand 是群落生态学中常用的工具包,提供了很多主流且高效的数据标准化方法。 基本语法 标准化,和转化相反,是求相对值,旨在降低数据之间因量级、单位等差异而带来的数...
Ensembl, EntreID,Symbol这三种基因名格式的互相转换 法1:org.Hs.eg.db包 法2:biomaRt包 将老鼠基因转为人类基因名 法1:直接转换 ...
生存分析KM法与Cox法异同 KM 方法即Kaplan-Meier survival estimate是一种无参数方法(non-parametric)来从观察的生存时间来估计...
首先调取Xena网页的TCGA数据做Cox生存分析,数据可以通过hiplot官网自主研发的ucsc-xena-shiny直接在线获取访问https://hiplot.com....
R实战 | Lasso回归模型建立及变量筛选 Tibshirani(1996) 引入了 LASSO (Least Absolute Shrinkage and Selecti...