40. 网络图绘制 清除当前环境中的变量 设置工作目录 使用igraph包绘制网络图 使用ggraph包绘制网络图 使用networkD3包绘制动态网络图
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R语言可视化（四十）：网络图绘制 -
如何用R语言做差异代谢物的kegg富集分析编写：王采荷 感觉已经很久没有在简书上分享自己的东西了，今天在集合其他大佬的力量终于把“如何用R语言做差异代谢物的kegg富集分析”这个问题给解决了。我决定将这个过程分享到简...
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R语言之数据标准化方法大全decostand 是群落生态学中常用的工具包，提供了很多主流且高效的数据标准化方法。 基本语法 标准化，和转化相反，是求相对值，旨在降低数据之间因量级、单位等差异而带来的数...
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[R]基因ID转换、鼠基因转为人基因
Ensembl, EntreID,Symbol这三种基因名格式的互相转换 法1：org.Hs.eg.db包 法2：biomaRt包 将老鼠基因转为人类基因名 法1：直接转换 ...
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TCGA+biomarker——单因素Cox回归
生存分析KM法与Cox法异同 KM 方法即Kaplan-Meier survival estimate是一种无参数方法(non-parametric)来从观察的生存时间来估计...
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单基因TCGA的Cox森林图怎么画才好看首先调取Xena网页的TCGA数据做Cox生存分析，数据可以通过hiplot官网自主研发的ucsc-xena-shiny直接在线获取访问https://hiplot.com....
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R实战 | Lasso回归模型建立及变量筛选R实战 | Lasso回归模型建立及变量筛选 Tibshirani(1996) 引入了 LASSO (Least Absolute Shrinkage and Selecti...
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ssGSEA分析ssGSEA即单样本GSEA分析，主要可以用来量化免疫浸润。 免疫浸润是什么？要是直白的解释就是免疫细胞渗透到肿瘤组织的程度。一般我们说肿瘤组织当中的成分，首先想到的是肿瘤细...
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【R>>DepMap】单基因肿瘤细胞表达情况CCLE是肿瘤细胞基因表达的百科全书，之前写CCLE：求任意基因的相关性[https://www.jianshu.com/p/59f979ab09ee]稍微介绍过其用法。今天...
