我不是老师,也不是大神,更不是前辈。我只是个普通的科研工作者,一个只想努力变得更好的人。 来到简书快3年了,期间写了不少的笔记。很多的笔记是在疫情严重时wfh的时候写的。至今...
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本篇代码参考文章:1.生信菜鸟团:一文学会WGCNA分析2.WGCNA(加权基因共表达网络分析)3.WGCNA分析,简单全面的最新教程4.WGCNA实战练习5.STEP6:W...
本文转载自:Bionifarmer[https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/14375487.html]。个人感觉非常好。如有侵权,请联系我。...
DNA就像缠绕在一起的绳索,包装好的DNA被称为染色质,其内部组织影响基因在每个细胞中如何发挥作用。核小体是由DNA与组蛋白形成的染色质基本结构单位,实际上通过移动开启或...
参考生信技能树1以及生信技能树2只记录从数据下载,到最终结果展示,具体生物学知识请自行查阅稍后关于ChIP-seq的背景知识我会再发布一篇文章。数据下载:数据存放地址关于环境...
1. 环境配置 2. 数据下载 (1)prefetch下载 首先找到要下载的数据(SRR...号)创建project文件夹 利用chipseq环境中prefetch 软件进行...
安装默认使用Conda macs2的基本命令 输出文件包括 为了方便在IGV上查看ChIP-seq的结果和后期的可视化展示,所以我们需要把macs2的结果转化为bw提供给IG...
整理ChIP-seq / CUT & Tag 分析时用到的工具。本文只对使用的工具用法进行简单介绍。 MACS2 是一款常用的peak calling软件,可以鉴定ChIP-...
在诸如:ChIP-seq、ATAC-seq、MeRIP-seq(m6A)、Cut&Tag中我们常常听到一个词Call Peak。Call Peak究竟是什么东西,得到的结果又...