一般的电脑配置都可以，我测试win核心数8运行内存16G也比较流畅
生信 | 生信人搭建数据库的学习流程写在前面 目前各种组学培训开展的如火如荼，却鲜有生物信息学数据库搭建的相关教程和学习流程。原因有以下几个： 1.学习数据库的搭建付出多，回报少。有这功夫应该可以把大部分组学知...
发简信
IP属地：江苏
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生信 | iSeq超便捷！快速下载GSA/SRA/ENA的数据以及metadata信息一、写在前面 最近在下载GSA数据的时候发现一个小工具iSeq，简直太好用了，分享给大家！iSeq的GitHub链接：https://github.com/BioOmics/...
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目前尝试使用TOBIAS： https://github.com/loosolab/TOBIAS
生信 | ATAC-Seq基础分析+高级分析+多组学分析
写在前面 其实很多作者已经探索的差不多了，相关脚本、教程也很多，但我还是自己系统的总结一下吧。有时候感觉是浪费时间，但是在写的时候能发现并学习到很多新的知识，不断记录反思，也...
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@一车小面包人 不是软件问题，配置问题
生信 | Circos实战
写在前面 由于circos官网的教程太全面了，虽然好但反而感觉比较复杂，难易上手，因此我将他们精简了一下。由于官网的教程中包含的数据太杂了，所以我精简了数据与代码放到了扣扣群...
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这里不是严格的bed，不用的
生信 | circos文件准备大全（以拟南芥为例）
一、写在前面 扣扣群：559758504（目前无需验证，一键即可加入） 如果你不想学，老板又催着要，你可以加群私聊我寻求帮助( $ _ $ )，但还是自己学，知识都是自己的。...
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@Yy0324 可以
生信 | ATAC-Seq基础分析+高级分析+多组学分析
写在前面 其实很多作者已经探索的差不多了，相关脚本、教程也很多，但我还是自己系统的总结一下吧。有时候感觉是浪费时间，但是在写的时候能发现并学习到很多新的知识，不断记录反思，也...
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加载比较慢造成的吧
生信 | IGV Web快速搭建（无需root，无需更改配置文件）
最近需要将ATAC-Seq生成的bw导入IGV查看peak的分布情况，但是一个个的将bw文件从服务器上下载到本地再传到IGV里面太麻烦了，偶然间就看到了IGV官网上有一个叫做...
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单细胞之轨迹分析-2：monocle2 原理解读+实操轨迹分析系列： 单细胞之轨迹分析-1：RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] 拟时间序列分析（Pseudot...
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@moral_vacuum 按理来说，R中得Warning message不会影响结果的输出呀，你看看有没有输出结果
生信 | 构建物种的OrgDb
写在前面 本文主要参考生信小白2018[https://www.jianshu.com/p/bb4281e6604e]与多啦A梦的时光机[https://www.jiansh...
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仅包含基因ID即可，含有列名（可随意定义）。按列排列
生信 | 构建物种的OrgDb
写在前面 本文主要参考生信小白2018[https://www.jianshu.com/p/bb4281e6604e]与多啦A梦的时光机[https://www.jiansh...
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win下面的文件夹没有删除权限
生信 | 构建物种的OrgDb
写在前面 本文主要参考生信小白2018[https://www.jianshu.com/p/bb4281e6604e]与多啦A梦的时光机[https://www.jiansh...
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放一下你的代码，因为大概率是你代码敲多或敲少一个括号
生信 | 构建物种的OrgDb
写在前面 本文主要参考生信小白2018[https://www.jianshu.com/p/bb4281e6604e]与多啦A梦的时光机[https://www.jiansh...
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@生信调包侠 参考： https://www.jianshu.com/p/44a3c17a64f1
生信 | 基因组组装实战（二）：Survey数据质控、NT比对
写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1. Survey分析的目的 ...
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@生信调包侠 你可以自己了解一下nt比对后的格式，自己调整，或者用别人写好的代码，如：https://blog.csdn.net/weixin_44616693/article/details/127179909
生信 | 基因组组装实战（二）：Survey数据质控、NT比对
写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1. Survey分析的目的 ...
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@生信调包侠 想突出显示某个染色体信息，并不一定需要放大，比较好的方法是调整染色体的间距和半径r的大小，从而实现突出重点。如：https://cn.bing.com/images/search?view=detailV2&;ccid=FzjmithH&id=D480FF075541F88BFBA612E4E64024EE980966AF&thid=OIP.FzjmithH5mASQPdpA8PJFwHaHa&mediaurl=https%3a%2f%2fwenlongshen.github.io%2fimg%2fpost%2f2017_03_26_circos_links.png&exph=500&expw=500&q=circos%e6%95%99%e7%a8%8b&simid=607992770496713063&FORM=IRPRST&ck=4363CC4492E0FA9A5C777A7289297A55&selectedIndex=19&ajaxhist=0&ajaxserp=0
生信 | circos文件准备大全（以拟南芥为例）
一、写在前面 扣扣群：559758504（目前无需验证，一键即可加入） 如果你不想学，老板又催着要，你可以加群私聊我寻求帮助( $ _ $ )，但还是自己学，知识都是自己的。...
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是“repos=NULL”，如果改正之后依旧不行的话，增加“type”，如：install.packages("/org.Cauratus.eg.db", repos=NULL, type="source")。依旧不行，win下面估计需要安装rtools之后再安装
生信 | 构建物种的OrgDb
写在前面 本文主要参考生信小白2018[https://www.jianshu.com/p/bb4281e6604e]与多啦A梦的时光机[https://www.jiansh...
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"./org.Cferus.eg.db/"中后面的/去掉
生信 | 构建物种的OrgDb
写在前面 本文主要参考生信小白2018[https://www.jianshu.com/p/bb4281e6604e]与多啦A梦的时光机[https://www.jiansh...
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在Win10中安装Ubuntu为什么要使用WSL 本地调试/测试服务器程序工作电脑是Win10系统，但目前大部分公司的服务器都是linux系统，某些要部署到服务器上的程序需要在本地进行测试时，因启动脚本都...
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所有物种均适用
生信 | 构建物种的OrgDb
写在前面 本文主要参考生信小白2018[https://www.jianshu.com/p/bb4281e6604e]与多啦A梦的时光机[https://www.jiansh...
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emapper中包含的只是K号，并不知道通路代表什么意思，使用通过json文件解析才能对应上，后面也用orgdb做的时候才能显示出来通路的名称，不然都是K号，你也不知道是什么
生信 | 构建物种的OrgDb
写在前面 本文主要参考生信小白2018[https://www.jianshu.com/p/bb4281e6604e]与多啦A梦的时光机[https://www.jiansh...