整理一下ggplot2中theme函数的用法,牵扯到很多参数,怕自己下次忘了。 一、自带主题 ggplot2有内置主题,分别是:theme_grey() 默认背景,浅灰色背景...
原文地址:NCBI Find the function of a gene or gene product 下面开始哦,我花了很长时间想,到底应该从哪个地方开始介绍NCBI资...
一、对应关系 NCBI的版本包括GRCh36,37,38,UCSC包括hg18,19,38, ENSEMBL有各种release,他们之间的对应关系如下:GRCh36 (hg...
R学习使用中,我们经常需要使用各种分析神器——package包。各种包的使用,不仅加快了数据分析的速度,也将某些不可能变成可能。那么,在海量第三方应用中,如何找到我们最需要、...
1. 机器学习基础知识入门 入门知识我没有太多可讲的,详细原理与基础知识可参考https://www.cnblogs.com/subconscious/p/4107357.h...
@Lynne_5ab4 FactoMineR包可以做主成分分析 R语言有自带的函数kmeans()做聚类分析 如果你说的是单细胞根据kmeans算法进行聚类我知道cellrangerRkit可以😁
单细胞测序R包PAGODA使用pagoda是2016年在nature methods发表的一个分析单细胞测序的方法,这个包并不是很红火,只是最近在学习另一个基于RNA速率推断细胞演化的R包velocyto...
pagoda是2016年在nature methods发表的一个分析单细胞测序的方法,这个包并不是很红火,只是最近在学习另一个基于RNA速率推断细胞演化的R包velocyto...
本贴出自徐州更老师的《生信必修课之软件安装》https://ke.qq.com/course/310838。仅做学习交流,不做商业用途,侵删。 打开终端 转到src文件夹下 ...
在R语言中 paste 是一个很有用的字符串处理函数,可以连接不同类型的变量及常量。 函数paste的一般使用格式为: paste(..., sep = " ", colla...
RNA-seq的数据分析是比较简单基础的分析,大概流程就是处理下机的fastq数据(trimmomatic),比对到人类基因组(hisat2)然后统计每个基因上出现的coun...
欢迎关注公众号:oddxix Novel recurrently mutated genes and a prognostic mutation signature in c...
介绍 背景介绍 细胞的基因组不断受到内源性和环境性dna损伤的威胁,例如紫外线和自发反应。为了维护它们的基因组完整性,细胞利用各种机制修复受损的dna。无论是在复制之前不正确...
你好,请问96个可能的三核苷酸变化是怎么计算出来的?为什么是96呢
R包——Mutational Pattern介绍 背景介绍 细胞的基因组不断受到内源性和环境性dna损伤的威胁,例如紫外线和自发反应。为了维护它们的基因组完整性,细胞利用各种机制修复受损的dna。无论是在复制之前不正确...
maftools是对WGS和WES数据进行上游分析之后,进行somatic mutation分析的一个非常好用的包,用非常简短的几行代码即可出图。 1.安装 maftools...