热图是科研论文中一种常见的可视化手段,而在转录组研究领域,我们常常需要分析一些基因与基因之间的相关性,来判断生物样本中是否存在共表达情况,以及共表达基因模块。除了基因集之间,...
相信很多人都看到过上面这种方块图,有点像“华夫饼图”的升级版,也有点像“热图”的离散版。我在一些临床多组学的文章里面看到过好几次这种图,用它来展示病人的临床信息非常合适,我自...
现在ChIP-seq的数据基本是最常见的测序数据类型之一,主要有Transcription factor ChIP-seq和Histone ChIP-seq。前者是看转录因子...
屏幕前的读者朋友你好啊,因为后台有很多读者留言想让我出一期关于R语言做出来较为精美的森林图的教程,而我在之前的推文(公众号:全哥的学习生涯)里并未对森林图的设置有过多的讲解,...
离散热图 0.需求 今天在群里看到一个非常漂亮的热图,我以为是什么奇怪的新R包画的,转了一圈发现原来还是大名鼎鼎的ComplexHeatmap丫。今天的代码都是在作者写的书基...
最近在看论文 Phased diploid genome assemblies and pan-genomes provide insights into the genet...
0.需求[http://222.70.95.243:6893/files/tmp/scale.html#%E9%9C%80%E6%B1%82] 如果直接拿基因的log表达量去...
今天要模仿的图片来自于论文 Core gut microbial communities are maintained by beneficial interactions ...
热图 热图概念:热图是一个以颜色变化来显示数据的矩阵,可以简单地聚合大量数据,并使用一种渐进的色带直观地展现空间数据的相对大小。 热图在生物学中的应用:生物学中热图经常用于展...
首先感谢Y叔的clusterprofiler神包,做富集分析优点是在线爬取数据,结果很可信,但是缺点也是网络问题,网络差点就要等很久,不过GSEA有自带GMT文件,因此下载好...