GATK现在最新的稳定版已经到了3.8,测试版是4.0。3.8版和之前的版本还是有比较大的不同的,但核心算法与4.0的差异不大,4.0主要整合GATK和picard工具并...
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这篇文章很长,超过1万字,是本系列中最重要的一篇,因为我并非只是在简单地告诉大家几条硬邦邦的操作命令。对于新手而言不建议碎片时间阅读,对于有一定经验的老手来说,相信依然可以有...
上次我们整理到bwa比对后得到bam文件,下一步我们要通过GATK流程从bam文件中call variant。 一、使用GATK前须知事项: 对GATK的测试主要使用的是人类...
大数据如此火爆的时代,各种人才倍受青睐。视野决定了境界和能力,而所处的环境又决定了视野。好多人不知道什么是数据分析师,认为会熟练使用Excel就是数据分析师,如果你还会使用E...
识别复杂生物系统中空间基因表达差异的能力对我们理解发育生物学和疾病的进展至关重要。即将推出的Visium空间基因表达解决方案分析完整组织切片中的总mRNA,允许您发现与您的研...