我的mzML数据同时有M1和M2数据,应该怎么处理呢,我尝试使用代码提取“file <- "./MSdata/20241123-100%C-Pos.mzML"
xs <- xcmsSet(file)
an <- xsAnnotate(xs)
#根据保留时间校正
anf <- groupFWHM(an, perfwhm = 0.6)
#鉴定同位素
ani <- findIsotopes(anf, mzabs = 0.01)
#确认分组
anic <- groupCorr(ani, cor_eic_th = 0.75)
#注释
anfa <- findAdducts(anic, polarity="negative")#positive negative
#导出数据
peaklist <- getPeaklist(anfa)”但是发现提取出来的数据,同时包含了M1和M2的mz。
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