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  • 我的mzML数据同时有M1和M2数据,应该怎么处理呢,我尝试使用代码提取“file <- "./MSdata/20241123-100%C-Pos.mzML"
    xs <- xcmsSet(file)
    an <- xsAnnotate(xs)

    #根据保留时间校正
    anf <- groupFWHM(an, perfwhm = 0.6)

    #鉴定同位素
    ani <- findIsotopes(anf, mzabs = 0.01)

    #确认分组
    anic <- groupCorr(ani, cor_eic_th = 0.75)

    #注释
    anfa <- findAdducts(anic, polarity="negative")#positive negative

    #导出数据
    peaklist <- getPeaklist(anfa)”但是发现提取出来的数据,同时包含了M1和M2的mz。

    R package:metID(七):代谢物的鉴定

    metid包来源于MetDNA中用于二级谱图匹配的算法,并进行了优化,又新加了能够用于in-house代谢物库构建的功能。 1. metid包的安装 metid是tidyma...

  • @佳名 能用来鉴定化合物吗

    R package:metID(七):代谢物的鉴定

    metid包来源于MetDNA中用于二级谱图匹配的算法,并进行了优化,又新加了能够用于in-house代谢物库构建的功能。 1. metid包的安装 metid是tidyma...

  • hmdb_database0.0.3.rda请问楼主这个文件去哪里弄呢

    R package:metID(七):代谢物的鉴定

    metid包来源于MetDNA中用于二级谱图匹配的算法,并进行了优化,又新加了能够用于in-house代谢物库构建的功能。 1. metid包的安装 metid是tidyma...