发简信
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开发一个Rshiny应用（基础）Introduction Shiny 是一个 R 包，可轻松地直接从 R 构建交互式 Web 应用程序。还可以在网页上托管独立应用程序或将它们嵌入 R Markdown 文档...
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转录组数据---从原理到分析(Hisat2+Stringtie+Deseq2)一、 首先放一段illumina测序平台的官方原理链接： https://www.bilibili.com/video/BV1Cx411p7dm[https://www.bi...
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我只是知识的搬运工~
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不积跬步，无以至千里。
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写了个小脚本autosnippy:自动cgSNP分析
最近写了一个snakemake流程，方便自己跑SNP分析。目前还是需要手动编辑一个文件表，剩下就是直接等着收树文件了。 安装 首先克隆git clone https://gi...
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我的SNP calling和核心SNP(core SNP)聚类分析流程
个人进行SNP分析用的软件是snippy[https://github.com/tseemann/snippy]，主要是可以一次批量完成。准备工作：1.待分析的序列文件（fa...
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让坚持成为习惯
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八. SNP检测和进化分析（Snippy）
一. 简介 Snippy[https://github.com/tseemann/snippy]是一款用于SNP检测的软件，可以通过分析得到核心SNP，进行比对构建进化树。 ...
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ReporterScore包(GRSA方法)正式发表于杂志Briefings in Bioinformatics最近，我开发的R包ReporterScore（GRSA方法）发表在Briefings in Bioinformatics上了，这是一种灵活的，可用于复杂多组学数据的功能富集新...
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浙江大学蒋超课题组合作ES&T：开发使用可穿戴被动采样器对个体生物和化学暴露组与转录组进行纵向测绘我们实验室的子诺师姐开发了一种新型的用于个体生物和化学暴露组纵向测绘的可穿戴被动采样器：AirPie。目前可以在一个驱蚊扣差不多大小的device上分析出数千种化合物和微生物...
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KEGG 数据库及API (2)Introduction KEGG[https://www.genome.jp/kegg/]（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）...
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KEGG 数据库及API (1)Introduction KEGG[https://www.genome.jp/kegg/]（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）...
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如何获取GO和KEGG注释、描述信息在非模式生物中，我们想要获取相应物种的GO或KEGG注释信息，或者描述信息的渠道很少。数据分布不集中，需要我们花费很长时间去收集，整合，才能得到相应的信息去做功能富集分析。下...
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遗传学 博士研究生在读
