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    16S测序分析(三)用LEfSe寻找组间差异细菌

    导读 前面已经介绍了获取菌属相对丰度表的方法,以及多样性分析中的基本概念和计算方法。接下来将开始介绍一种寻找组间差异细菌的常用方法LEfSe。LEfSe(Linear dis...

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    R:Bray-Curtis NMDS

    导读 Bray-Curtis NMDS降维分析菌群结构。 一、输入数据 1.1 菌属丰度矩阵 1.2 样品分组 二、BC NMDS函数 三、分析及结果 3.1 结果文件 3....

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    非度量多维尺度(NMDS)分析及R绘图

    先上图 注:填充颜色由AI处理。 (样本和分组文件如下)(这里只是展示数据形式并不是原数据(分组名与代码中不一样)) vegan分析数据 行名样本,列名物种,内容丰度。 绘图...