WGCNA:加权基因共表达网络分析,简而言之,就是将基因划分为若干个模块,探究与表型数据与基因模块之间的相关关系,并找到模块中的核心基因。 适用于复杂的数据模式,推荐5组(或...
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[连锁不平衡粗俗的说就是:这几个基因耍流氓,喜欢抱团遗传,不再随机。而连锁不平衡衰减是指在基因组上,随着物理距离的增大,两个连锁的的等位基因的连锁程度不断减小。] LD衰减图...
大佬牛逼
全基因组关联分析学习资料(GWAS tutorial)20210313更新版时隔一年多,于今日(20210313)再次更新教程,后续如果新出教程的话会一直更新。 同时感谢多年陪伴我成长、一直默默关注我的「你们」~ by 「橙子牛奶糖(陈文燕)」 1....
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比较基因组学 比较基因组学(Comparative genomics):是基于基因组图谱和测序技术,对已知的基因特征和基因组结构进行比较以了解基因的功能、表达机制和不同物种亲...
RNA-seq即转录组测序技术,就是把mRNA,smallRNA等用高通量测序技术把它们的序列测出来,反映出它们的表达水平。 mRNA:信使message RNA是由DNA的...
前言 很多人问我有没有关于全基因组关联分析(GWAS)原理的书籍或者文章推荐。 其实我个人觉得,做这个分析,先从跑流程开始,再去看原理。 为什么这么说呢,因为对于初学者来说,...
作者:Philip Yang 链接:https://www.zhihu.com/question/27695566/answer/40741777 来源:知乎 著作权归作者所...
1.QTL:Quantitative Trait Loci,概念自己查,说的是基因型和snp位点的关系,多用于单一种群,遗传背景简单的,避免受population struc...
mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS)作用:通过对多个表型相似的GWAS summary结果进行联合分析,发现更多的表型相关基因座。以抑郁症状...